Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1906183	1906194	12	45 [0]	[0] 102	manZ	mannose‑specific enzyme IID component of PTS

CTCCAAAGGTATCGATATCGTTAAAGATATGGGTGGTGGCTTCCTGCAAAAACTGACGGAAGGGG  >  W3110S.gb/1906118‑1906182                                                                 | cTCCAAAGGTATCGATATCGTTAAAGATATGGGTGGTGTCTTCCTGCAAAAACTGACGGAAgggg  >  1:1116218/1‑65 (MQ=255) cTCCAAAGGTATCGATATCGTTAAAGATATGGGTGGTGGGTTCCTGCAAAAACTGACGGAAgggg  >  1:915121/1‑65 (MQ=255) cTCCAAAGGTATCGATATCGTTAAAGATATGGGTGGTGGCTTCCTGCAAAAACTGACGGAAgggg  >  1:384894/1‑65 (MQ=255) cTCCAAAGGTATCGATATCGTTAAAGATATGGGTGGTGGCTTCCTGCAAAAACTGACGGAAgggg  >  1:971934/1‑65 (MQ=255) cTCCAAAGGTATCGATATCGTTAAAGATATGGGTGGTGGCTTCCTGCAAAAACTGACGGAAgggg  >  1:416136/1‑65 (MQ=255) cTCCAAAGGTATCGATATCGTTAAAGATATGGGTGGTGGCTTCCTGCAAAAACTGACGGAAgggg  >  1:443403/1‑65 (MQ=255) cTCCAAAGGTATCGATATCGTTAAAGATATGGGTGGTGGCTTCCTGCAAAAACTGACGGAAgggg  >  1:481385/1‑65 (MQ=255) cTCCAAAGGTATCGATATCGTTAAAGATATGGGTGGTGGCTTCCTGCAAAAACTGACGGAAgggg  >  1:489191/1‑65 (MQ=255) cTCCAAAGGTATCGATATCGTTAAAGATATGGGTGGTGGCTTCCTGCAAAAACTGACGGAAgggg  >  1:528724/1‑65 (MQ=255) cTCCAAAGGTATCGATATCGTTAAAGATATGGGTGGTGGCTTCCTGCAAAAACTGACGGAAgggg  >  1:609535/1‑65 (MQ=255) cTCCAAAGGTATCGATATCGTTAAAGATATGGGTGGTGGCTTCCTGCAAAAACTGACGGAAgggg  >  1:630000/1‑65 (MQ=255) cTCCAAAGGTATCGATATCGTTAAAGATATGGGTGGTGGCTTCCTGCAAAAACTGACGGAAgggg  >  1:646442/1‑65 (MQ=255) cTCCAAAGGTATCGATATCGTTAAAGATATGGGTGGTGGCTTCCTGCAAAAACTGACGGAAgggg  >  1:648769/1‑65 (MQ=255) cTCCAAAGGTATCGATATCGTTAAAGATATGGGTGGTGGCTTCCTGCAAAAACTGACGGAAgggg  >  1:654879/1‑65 (MQ=255) cTCCAAAGGTATCGATATCGTTAAAGATATGGGTGGTGGCTTCCTGCAAAAACTGACGGAAgggg  >  1:729897/1‑65 (MQ=255) cTCCAAAGGTATCGATATCGTTAAAGATATGGGTGGTGGCTTCCTGCAAAAACTGACGGAAgggg  >  1:741955/1‑65 (MQ=255) cTCCAAAGGTATCGATATCGTTAAAGATATGGGTGGTGGCTTCCTGCAAAAACTGACGGAAgggg  >  1:775132/1‑65 (MQ=255) cTCCAAAGGTATCGATATCGTTAAAGATATGGGTGGTGGCTTCCTGCAAAAACTGACGGAAgggg  >  1:856329/1‑65 (MQ=255) cTCCAAAGGTATCGATATCGTTAAAGATATGGGTGGTGGCTTCCTGCAAAAACTGACGGAAgggg  >  1:880708/1‑65 (MQ=255) cTCCAAAGGTATCGATATCGTTAAAGATATGGGTGGTGGCTTCCTGCAAAAACTGACGGAAgggg  >  1:901824/1‑65 (MQ=255) cTCCAAAGGTATCGATATCGTTAAAGATATGGGTGGTGGCTTCCTGCAAAAACTGACGGAAgggg  >  1:94705/1‑65 (MQ=255) cTCCAAAGGTATCGATATCGTTAAAGATATGGGTGGTGGCTTCCTGCAAAAACTGACGGAAgggg  >  1:957905/1‑65 (MQ=255) cTCCAAAGGTATCGATATCGTTAAAGATATGGGTGGTGGCTTCCTGCAAAAACTGACGGAAgggg  >  1:1040321/1‑65 (MQ=255) cTCCAAAGGTATCGATATCGTTAAAGATATGGGTGGTGGCTTCCTGCAAAAACTGACGGAAgggg  >  1:1732226/1‑65 (MQ=255) cTCCAAAGGTATCGATATCGTTAAAGATATGGGTGGTGGCTTCCTGCAAAAACTGACGGAAgggg  >  1:1205407/1‑65 (MQ=255) cTCCAAAGGTATCGATATCGTTAAAGATATGGGTGGTGGCTTCCTGCAAAAACTGACGGAAgggg  >  1:1245772/1‑65 (MQ=255) cTCCAAAGGTATCGATATCGTTAAAGATATGGGTGGTGGCTTCCTGCAAAAACTGACGGAAgggg  >  1:1265069/1‑65 (MQ=255) cTCCAAAGGTATCGATATCGTTAAAGATATGGGTGGTGGCTTCCTGCAAAAACTGACGGAAgggg  >  1:1363731/1‑65 (MQ=255) cTCCAAAGGTATCGATATCGTTAAAGATATGGGTGGTGGCTTCCTGCAAAAACTGACGGAAgggg  >  1:1383278/1‑65 (MQ=255) cTCCAAAGGTATCGATATCGTTAAAGATATGGGTGGTGGCTTCCTGCAAAAACTGACGGAAgggg  >  1:1463001/1‑65 (MQ=255) cTCCAAAGGTATCGATATCGTTAAAGATATGGGTGGTGGCTTCCTGCAAAAACTGACGGAAgggg  >  1:1588236/1‑65 (MQ=255) cTCCAAAGGTATCGATATCGTTAAAGATATGGGTGGTGGCTTCCTGCAAAAACTGACGGAAgggg  >  1:1637752/1‑65 (MQ=255) cTCCAAAGGTATCGATATCGTTAAAGATATGGGTGGTGGCTTCCTGCAAAAACTGACGGAAgggg  >  1:1640986/1‑65 (MQ=255) cTCCAAAGGTATCGATATCGTTAAAGATATGGGTGGTGGCTTCCTGCAAAAACTGACGGAAgggg  >  1:166282/1‑65 (MQ=255) cTCCAAAGGTATCGATATCGTTAAAGATATGGGTGGTGGCTTCCTGCAAAAACTGACGGAAgggg  >  1:382921/1‑65 (MQ=255) cTCCAAAGGTATCGATATCGTTAAAGATATGGGTGGTGGCTTCCTGCAAAAACTGACGGAAgggg  >  1:1739464/1‑65 (MQ=255) cTCCAAAGGTATCGATATCGTTAAAGATATGGGTGGTGGCTTCCTGCAAAAACTGACGGAAgggg  >  1:1744003/1‑65 (MQ=255) cTCCAAAGGTATCGATATCGTTAAAGATATGGGTGGTGGCTTCCTGCAAAAACTGACGGAAgggg  >  1:178682/1‑65 (MQ=255) cTCCAAAGGTATCGATATCGTTAAAGATATGGGTGGTGGCTTCCTGCAAAAACTGACGGAAgggg  >  1:1802710/1‑65 (MQ=255) cTCCAAAGGTATCGATATCGTTAAAGATATGGGTGGTGGCTTCCTGCAAAAACTGACGGAAgggg  >  1:1822963/1‑65 (MQ=255) cTCCAAAGGTATCGATATCGTTAAAGATATGGGTGGTGGCTTCCTGCAAAAACTGACGGAAgggg  >  1:228529/1‑65 (MQ=255) cTCCAAAGGTATCGATATCGTTAAAGATATGGGTGGTGGCTTCCTGCAAAAACTGACGGAAgggg  >  1:237089/1‑65 (MQ=255) cTCCAAAGGTATCGATATCGTTAAAGATATGGGTGGTGGCTTCCTGCAAAAACTGACGGAAgggg  >  1:337750/1‑65 (MQ=255) cTCCAAAGGTATCGATATCGTTAAAGATATGGGTGGTGGCTTCCTGCAAAAACTGACGGAAgggg  >  1:367514/1‑65 (MQ=255) cTCCAAAGGTATCGATATCGTTAAAGATATGGGTGGTGGCTTCCTGCAAAAACTGACGGAAgggg  >  1:381621/1‑65 (MQ=255)                                                                 | CTCCAAAGGTATCGATATCGTTAAAGATATGGGTGGTGGCTTCCTGCAAAAACTGACGGAAGGGG  >  W3110S.gb/1906118‑1906182

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑