Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1964359	1964763	405	18 [0]	[0] 42	[flhE]–[flhA]	[flhE],[flhA]

TCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGC  >  W3110S.gb/1964294‑1964358                                                                 | tCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGc  <  1:1112613/65‑1 (MQ=255) tCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGc  <  1:567110/65‑1 (MQ=255) tCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGc  <  1:559995/65‑1 (MQ=255) tCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGc  <  1:558923/65‑1 (MQ=255) tCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGc  <  1:474363/65‑1 (MQ=255) tCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGc  <  1:3906/65‑1 (MQ=255) tCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGc  <  1:364891/65‑1 (MQ=255) tCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGc  <  1:327287/65‑1 (MQ=255) tCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGc  <  1:296341/65‑1 (MQ=255) tCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGc  <  1:1653260/65‑1 (MQ=255) tCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGc  <  1:1571818/65‑1 (MQ=255) tCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGc  <  1:1019276/65‑1 (MQ=255) tCAGCGATAAATCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGc  <  1:1552782/65‑1 (MQ=255) tCAGAGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGc  <  1:298488/65‑1 (MQ=255)  cAGCGATAATTCACAATCCCTTCATTACGTTTTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGc  <  1:734406/64‑1 (MQ=255)  cAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGc  <  1:838120/64‑1 (MQ=255)          aTTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGc  <  1:574684/56‑1 (MQ=255)                 aTCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGCGGGGGAATTAACCGCCCACCGc  <  1:508808/49‑1 (MQ=255)                                                                 | TCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGC  >  W3110S.gb/1964294‑1964358

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑