Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2004264	2004356	93	25 [0]	[0] 148	fliC	flagellar filament structural protein

TTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGCAGCAGAG  >  W3110S.gb/2004229‑2004263                                   | ttAATCAGGTTACAACGATTATCCCTGCAGCagag  <  1:158922/35‑1 (MQ=255) ttAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGCAGCagag  <  1:1783924/35‑1 (MQ=255) ttAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGCAGCagag  <  1:934392/35‑1 (MQ=255) ttAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGCAGCagag  <  1:894260/35‑1 (MQ=255) ttAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGCAGCagag  <  1:865064/35‑1 (MQ=255) ttAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGCAGCagag  <  1:802437/35‑1 (MQ=255) ttAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGCAGCagag  <  1:742404/35‑1 (MQ=255) ttAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGCAGCagag  <  1:714306/35‑1 (MQ=255) ttAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGCAGCagag  <  1:62777/35‑1 (MQ=255) ttAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGCAGCagag  <  1:582914/35‑1 (MQ=255) ttAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGCAGCagag  <  1:417939/35‑1 (MQ=255) ttAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGCAGCagag  <  1:40513/35‑1 (MQ=255) ttAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGCAGCagag  <  1:1853836/35‑1 (MQ=255) ttAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGCAGCagag  <  1:1813253/35‑1 (MQ=255) ttAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGCAGCagag  <  1:1052897/35‑1 (MQ=255) ttAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGCAGCagag  <  1:1757944/35‑1 (MQ=255) ttAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGCAGCagag  <  1:1738743/35‑1 (MQ=255) ttAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGCAGCagag  <  1:1666452/35‑1 (MQ=255) ttAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGCAGCagag  <  1:1625215/35‑1 (MQ=255) ttAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGCAGCagag  <  1:1621069/35‑1 (MQ=255) ttAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGCAGCagag  <  1:1484787/35‑1 (MQ=255) ttAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGCAGCagag  <  1:1394645/35‑1 (MQ=255) ttAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGCAGCagag  <  1:1280344/35‑1 (MQ=255) ttAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGCAGCagag  <  1:1260815/35‑1 (MQ=255) ttAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGCAGCagag  <  1:1113308/35‑1 (MQ=255)                                   | TTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGCAGCAGAG  >  W3110S.gb/2004229‑2004263

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑