Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 2008517 2008668 152 116 [0] [0] 80 amyA cytoplasmic alpha‑amylase

Only 100 of 116 total aligned reads displayed.

TCGGCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCCTAC  >  W3110S.gb/2008453‑2008516
                                                               |
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCTAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:1875827/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGATAGGCAGCATCCctac  <  1:1847805/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:268469/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:401996/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:400552/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:399735/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:387738/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:383221/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:37314/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:368543/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:342310/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:332099/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:299522/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:275098/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:433134/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:248631/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:230747/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:190627/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:1868205/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:1855731/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:1842175/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:1023555/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:1799963/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:1779544/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:629354/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:942489/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:909827/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:870326/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:808676/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:79803/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:782521/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:720720/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:674060/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:651163/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:637923/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:632091/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:1838775/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:618402/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:618070/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:57975/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:549967/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:529322/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:529181/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:526477/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:505326/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:500766/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:453165/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:1273242/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:1448981/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:1441828/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:1085940/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:1417179/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:1088188/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:1393741/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:1384809/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:1349232/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:1335895/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:1317367/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:1061453/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:12598/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:1236819/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:1198428/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:1181427/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:1172646/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:116889/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:1145458/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:1090952/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:1137730/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:174232/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:1684531/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:167823/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:1670091/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:1685847/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:1654420/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:1636170/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:1460797/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:1719802/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:1580977/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:1563729/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:1560011/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:1555509/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:152427/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:1501094/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:1488732/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:1065639/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:1466765/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCcgac  <  1:53416/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGAGCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:260486/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGGTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:1091026/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGACTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:1606152/64‑1 (MQ=255)
tcggCTACGACTCCTATGATTTATTTGAATTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:1223724/64‑1 (MQ=255)
 cggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:436964/63‑1 (MQ=255)
 cggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:762559/63‑1 (MQ=255)
 cggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:114193/63‑1 (MQ=255)
 cggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:1748297/63‑1 (MQ=255)
 cggCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:1481097/63‑1 (MQ=255)
    cTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:1786288/60‑1 (MQ=255)
      aCGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCTGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:856755/58‑1 (MQ=255)
         aCTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:739082/55‑1 (MQ=255)
                  atttatttGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCctac  <  1:1436513/46‑1 (MQ=255)
                                                               |
TCGGCTACGACTCCTATGATTTATTTGATTTAGGCGAGTTTGATCAGAAAGGCAGCATCCCTAC  >  W3110S.gb/2008453‑2008516

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑