Missing coverage evidence... | ||||||||||
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seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | W3110S.gb | 2014849 | 2014907 | 59 | 51 [0] | [0] 4 | intG fliE |
ECK1934:JW5913:b1936; predicted defective phage integrase flagellar basal‑body component |
CATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCAT > W3110S.gb/2014784‑2014848 | catccatGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCAt < 1:621329/65‑1 (MQ=255) catccatGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCAt < 1:1014905/65‑1 (MQ=255) catccatGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCAt < 1:256346/65‑1 (MQ=255) catccatGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCAt < 1:266190/65‑1 (MQ=255) catccatGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCAt < 1:269025/65‑1 (MQ=255) catccatGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCAt < 1:29411/65‑1 (MQ=255) catccatGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCAt < 1:398117/65‑1 (MQ=255) catccatGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCAt < 1:408626/65‑1 (MQ=255) catccatGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCAt < 1:475484/65‑1 (MQ=255) catccatGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCAt < 1:50283/65‑1 (MQ=255) catccatGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCAt < 1:59171/65‑1 (MQ=255) catccatGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCAt < 1:616314/65‑1 (MQ=255) catccatGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCAt < 1:618333/65‑1 (MQ=255) catccatGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCAt < 1:213178/65‑1 (MQ=255) catccatGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCAt < 1:628103/65‑1 (MQ=255) catccatGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCAt < 1:629360/65‑1 (MQ=255) catccatGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCAt < 1:630703/65‑1 (MQ=255) catccatGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCAt < 1:647643/65‑1 (MQ=255) catccatGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCAt < 1:693470/65‑1 (MQ=255) catccatGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCAt < 1:751286/65‑1 (MQ=255) catccatGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCAt < 1:769644/65‑1 (MQ=255) catccatGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCAt < 1:834944/65‑1 (MQ=255) catccatGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCAt < 1:841218/65‑1 (MQ=255) catccatGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCAt < 1:866140/65‑1 (MQ=255) catccatGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCAt < 1:907732/65‑1 (MQ=255) catccatGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCAt < 1:1812083/65‑1 (MQ=255) catccatGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCAt < 1:1139640/65‑1 (MQ=255) catccatGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCAt < 1:116662/65‑1 (MQ=255) catccatGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCAt < 1:1213831/65‑1 (MQ=255) catccatGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCAt < 1:1262944/65‑1 (MQ=255) catccatGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCAt < 1:1354061/65‑1 (MQ=255) catccatGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCAt < 1:1368231/65‑1 (MQ=255) catccatGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCAt < 1:1389209/65‑1 (MQ=255) catccatGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCAt < 1:1390841/65‑1 (MQ=255) catccatGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCAt < 1:1437723/65‑1 (MQ=255) catccatGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCAt < 1:1442338/65‑1 (MQ=255) catccatGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCAt < 1:1492395/65‑1 (MQ=255) catccatGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCAt < 1:1598156/65‑1 (MQ=255) catccatGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCAt < 1:1636010/65‑1 (MQ=255) catccatGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCAt < 1:1654666/65‑1 (MQ=255) catccatGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCAt < 1:1657098/65‑1 (MQ=255) catccatGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCAt < 1:1674606/65‑1 (MQ=255) catccatGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCAt < 1:1759520/65‑1 (MQ=255) catccatGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCAt < 1:1866155/65‑1 (MQ=255) atccatGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCAt < 1:1447809/64‑1 (MQ=255) atccatGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCAt < 1:1719599/64‑1 (MQ=255) atccatGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCAt < 1:903537/64‑1 (MQ=255) tccatGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCAt < 1:360030/63‑1 (MQ=255) cccACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCAt < 1:1466976/56‑1 (MQ=255) cgcgGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCAt < 1:1581390/52‑1 (MQ=255) agaTCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCAt < 1:1389508/45‑1 (MQ=255) | CATCCATGCCCCACGCGGTGAGATCGGATGTAATTAACAACAGGTTACAAAACCTACACCTGCAT > W3110S.gb/2014784‑2014848 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |