Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 2020767 2021169 403 113 [0] [0] 39 fliK flagellar hook‑length control protein

Only 100 of 113 total aligned reads displayed.

AGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTGG  >  W3110S.gb/2020702‑2020766
                                                                |
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGGCGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:52913/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:397688/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:535568/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:534813/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:533992/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:530588/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:494235/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:489307/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:484712/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:46841/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:467433/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:464241/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:45431/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:555155/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:357842/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:346404/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:335066/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:331023/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:325653/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:313528/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:31187/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:292036/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:27347/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:259229/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:1043587/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:802864/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:989732/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:987444/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:979196/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:968833/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:926649/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:92091/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:908002/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:866288/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:84552/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:835731/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:819924/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:819684/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:240428/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:792225/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:769010/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:739354/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:733286/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:704769/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:666898/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:647430/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:622443/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:590846/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:57717/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:557259/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:1206251/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:1437193/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:1396966/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:1396262/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:1378764/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:1319534/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:130540/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:1301035/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:1293311/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:1282981/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:1266907/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:1265959/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:1224206/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:1525810/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:1199391/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:1195023/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:1184127/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:1181314/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:1169544/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:115745/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:1106559/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:1074859/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:1070691/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:1063399/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:1048131/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:1534548/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:206295/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:204446/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:202514/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:1875398/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:1865884/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:1858221/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:1802429/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:1786553/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:1782628/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:1776500/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:1757191/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:1751534/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:1731219/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:168738/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:1647071/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:1612486/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:1588012/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:1560205/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:1552255/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:238376/65‑1 (MQ=255)
aGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAAATTACTGATCCCTGTgg  <  1:208651/65‑1 (MQ=255)
     aGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:47160/60‑1 (MQ=255)
       ccGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:1874096/58‑1 (MQ=255)
                 gCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTgg  <  1:18357/48‑1 (MQ=255)
                                                                |
AGGCGAGCCGCTGATCAGCGATATTGTTTCCGACGCGCAACAAGCTAATTTACTGATCCCTGTGG  >  W3110S.gb/2020702‑2020766

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑