Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 2025777 2025814 38 108 [1] [0] 111 fliR flagellar export pore protein

Only 100 of 108 total aligned reads displayed.

TAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAATT  >  W3110S.gb/2025712‑2025777
                                                                | 
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGATCATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:862861/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGGAATTTTTAAt   >  1:613957/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:247574/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:445270/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:422152/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:383695/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:366784/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:356930/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:346526/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:337247/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:312874/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:310912/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:285739/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:254170/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:446958/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:218394/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:1870718/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:1857916/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:1854208/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:1841950/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:1834957/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:1834499/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:1807455/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:1804221/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:1793249/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:1002279/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:685993/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:911414/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:910129/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:902084/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:899892/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:876048/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:875514/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:848179/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:758736/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:740706/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:700219/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:697646/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:446935/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:683674/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:662190/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:626377/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:618010/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:584024/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:564676/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:554099/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:541362/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:541248/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:535360/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:179323/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:1116781/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:1779406/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:1306885/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:1242252/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:1238513/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:123460/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:1232687/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:1186854/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:118530/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:1166234/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:1120902/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:1118633/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:1313880/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:1098339/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:1098082/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:1091301/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:106392/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:1061384/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:1052408/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:1047908/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:104001/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:102574/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:1012495/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:1006052/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:1544302/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:1732022/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:1725236/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:1717474/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:1705180/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:168844/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:1662787/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:1625053/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:1623529/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:1622943/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:1621972/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:1594535/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:1359197/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:1529394/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:1484872/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:1457228/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:1454317/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:1442846/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:1427153/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:1406887/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:1398348/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:1397151/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:1389375/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:1378743/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGT‑AAATTTTTAAtt  >  1:1033147/1‑65 (MQ=255)
tAATGGCGCCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAAt   >  1:552144/1‑65 (MQ=255)
                                                                | 
TAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAATT  >  W3110S.gb/2025712‑2025777

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑