Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	2075733	2075899	167	29 [0]	[0] 119	flu	antigen 43 (Ag43) phase‑variable biofilm formation autotransporter

ATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACAGGCTGCAGGCCGGTGCCTT  >  W3110S.gb/2075668‑2075732                                                                 | aTTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCTGGGGAACAGGCTGCAGGCCGGTGCCtt  <  1:1075535/65‑1 (MQ=255) aTTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACAGGCTGCAGGCCTGTGCCtt  <  1:647942/65‑1 (MQ=255) aTTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACAGGCTGCAGGCCGGTGCCtt  <  1:1834738/65‑1 (MQ=255) aTTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACAGGCTGCAGGCCGGTGCCtt  <  1:785821/65‑1 (MQ=255) aTTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACAGGCTGCAGGCCGGTGCCtt  <  1:764249/65‑1 (MQ=255) aTTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACAGGCTGCAGGCCGGTGCCtt  <  1:75299/65‑1 (MQ=255) aTTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACAGGCTGCAGGCCGGTGCCtt  <  1:630529/65‑1 (MQ=255) aTTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACAGGCTGCAGGCCGGTGCCtt  <  1:493806/65‑1 (MQ=255) aTTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACAGGCTGCAGGCCGGTGCCtt  <  1:343952/65‑1 (MQ=255) aTTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACAGGCTGCAGGCCGGTGCCtt  <  1:298887/65‑1 (MQ=255) aTTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACAGGCTGCAGGCCGGTGCCtt  <  1:28687/65‑1 (MQ=255) aTTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACAGGCTGCAGGCCGGTGCCtt  <  1:263487/65‑1 (MQ=255) aTTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACAGGCTGCAGGCCGGTGCCtt  <  1:1837735/65‑1 (MQ=255) aTTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACAGGCTGCAGGCCGGTGCCtt  <  1:1783879/65‑1 (MQ=255) aTTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACAGGCTGCAGGCCGGTGCCtt  <  1:1754572/65‑1 (MQ=255) aTTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACAGGCTGCAGGCCGGTGCCtt  <  1:1594210/65‑1 (MQ=255) aTTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACAGGCTGCAGGCCGGTGCCtt  <  1:158666/65‑1 (MQ=255) aTTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACAGGCTGCAGGCCGGTGCCtt  <  1:1577963/65‑1 (MQ=255) aTTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACAGGCTGCAGGCCGGTGCCtt  <  1:149902/65‑1 (MQ=255) aTTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACAGGCTGCAGGCCGGTGCCtt  <  1:1373768/65‑1 (MQ=255) aTTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACAGGCTGCAGGCCGGTGCCtt  <  1:1364760/65‑1 (MQ=255) aTTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACAGGCTGCAGGCCGGTGCCtt  <  1:1360621/65‑1 (MQ=255) aTTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACAGGCTGCAGGCCGGTGCCtt  <  1:1317480/65‑1 (MQ=255) aTTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACAGGCTGCAGGCCGGTGCCtt  <  1:1173319/65‑1 (MQ=255)  ttAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACAGGCTGCAGGCCGGTGCCtt  <  1:204219/64‑1 (MQ=255)  ttAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACAGGCTGCAGGCCGGTGCCtt  <  1:741807/64‑1 (MQ=255)  ttAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACAGGCTGCAGGCCGGTGCCtt  <  1:1184524/64‑1 (MQ=255)        gTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACAGGCTGCAGGCCGGTGCCtt  <  1:1298517/58‑1 (MQ=255)                          gggCCTTTGTCCAGGGGAACAGGCTGCAGGCCGGTGCCtt  <  1:249060/40‑1 (MQ=255)                                                                 | ATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACAGGCTGCAGGCCGGTGCCTT  >  W3110S.gb/2075668‑2075732

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑