Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | W3110S.gb | 2103780 | 2103780 | 1 | 94 [0] | [0] 80 | wbbL wbbL |
ECK2025:JW2012:b4540; lipopolysaccharide biosynthesis protein, C‑ter fragment ECK2025:JW2016+JW2012:b4571; lipopolysaccharide biosynthesis protein |
GCCAGGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCA > W3110S.gb/2103714‑2103779 | gccagGCTAAGCCTCAA‑CACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:889561/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACTTAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:78806/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTACCCTTGATCGAAGCCa < 1:563335/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCTAAGCCa < 1:1641982/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:307829/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:511883/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:507645/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:471622/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:462404/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:457868/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:447207/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:444646/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:405188/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:343324/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:327111/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:323637/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:1739032/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:286173/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:237808/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:217307/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:198483/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:1807872/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:1774189/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:1021402/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:1770337/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:739730/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:993444/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:924109/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:916532/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:866158/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:856706/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:835902/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:785758/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:778931/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:76028/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:756686/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:537908/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:716031/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:68483/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:65828/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:64642/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:619390/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:618290/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:595297/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:594855/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:572451/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:1280244/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:1697718/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:1388797/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:1381485/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:1360878/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:1328095/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:1314284/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:1306357/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:1299498/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:1296954/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:1295218/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:1291307/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:1390103/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:1242341/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:1240595/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:1197738/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:1189043/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:1179181/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:1147929/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:1131699/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:1084357/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:1066141/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:1041516/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:1023961/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:1405783/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:1644935/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:1618090/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:1616626/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:1591274/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:157044/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:1544169/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:1543316/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:1528087/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:150623/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:1486924/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:1486470/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:1461110/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:144012/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:1426013/65‑1 (MQ=255) ccagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:141670/65‑1 (MQ=255) cagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:161840/64‑1 (MQ=255) cagGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:1658164/64‑1 (MQ=255) agGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:1598620/63‑1 (MQ=255) gCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:512074/61‑1 (MQ=255) tAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:267592/59‑1 (MQ=255) cAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:369281/52‑1 (MQ=255) aaTATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:135659/40‑1 (MQ=255) atCTTCAGAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCa < 1:397121/37‑1 (MQ=255) | GCCAGGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAAAGTAACCTTGATCGAAGCCA > W3110S.gb/2103714‑2103779 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |