Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2110993	2111648	656	30 [0]	[0] 104	rfbX	predicted polisoprenol‑linked O‑antigen transporter

TTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGG  >  W3110S.gb/2110929‑2110992                                                                | ttAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGCCGTTgg  >  1:147916/1‑64 (MQ=255) ttAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTgg  >  1:1859422/1‑64 (MQ=255) ttAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTgg  >  1:95770/1‑64 (MQ=255) ttAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTgg  >  1:793832/1‑64 (MQ=255) ttAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTgg  >  1:780154/1‑64 (MQ=255) ttAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTgg  >  1:713020/1‑64 (MQ=255) ttAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTgg  >  1:677343/1‑64 (MQ=255) ttAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTgg  >  1:639341/1‑64 (MQ=255) ttAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTgg  >  1:621687/1‑64 (MQ=255) ttAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTgg  >  1:442904/1‑64 (MQ=255) ttAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTgg  >  1:441699/1‑64 (MQ=255) ttAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTgg  >  1:360881/1‑64 (MQ=255) ttAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTgg  >  1:268378/1‑64 (MQ=255) ttAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTgg  >  1:254513/1‑64 (MQ=255) ttAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTgg  >  1:1003447/1‑64 (MQ=255) ttAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTgg  >  1:1689669/1‑64 (MQ=255) ttAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTgg  >  1:1622810/1‑64 (MQ=255) ttAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTgg  >  1:1607514/1‑64 (MQ=255) ttAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTgg  >  1:1488925/1‑64 (MQ=255) ttAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTgg  >  1:1452908/1‑64 (MQ=255) ttAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTgg  >  1:1339557/1‑64 (MQ=255) ttAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTgg  >  1:1321449/1‑64 (MQ=255) ttAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTgg  >  1:1316180/1‑64 (MQ=255) ttAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTgg  >  1:1194483/1‑64 (MQ=255) ttAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTgg  >  1:1161250/1‑64 (MQ=255) ttAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTgg  >  1:1053280/1‑64 (MQ=255) ttAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTgg  >  1:1024458/1‑64 (MQ=255) ttAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTgg  >  1:101719/1‑64 (MQ=255) ttAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCACTACGGACGTTgg  >  1:718203/1‑64 (MQ=255) ttAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTACCTACGGACGTTgg  >  1:672688/1‑64 (MQ=255)                                                                | TTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGG  >  W3110S.gb/2110929‑2110992

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑