Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	2161565	2161619	55	27 [0]	[0] 42	mdtC	multidrug efflux system, subunit C

CATTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGGCGCTGGTGATTCTGG  >  W3110S.gb/2161500‑2161564                                                                 | caTTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGCGCAAACGCTGATTATCTCGGTGGCGCTGGTGATTCtgg  >  1:1856360/1‑65 (MQ=255) caTTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAACCGCTGATTATCTCGGTGGCGCTGGTGATTCtgg  >  1:1858846/1‑65 (MQ=255) caTTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGGCGCTGGTGATTCtgg  >  1:175731/1‑65 (MQ=255) caTTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGGCGCTGGTGATTCtgg  >  1:99274/1‑65 (MQ=255) caTTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGGCGCTGGTGATTCtgg  >  1:917189/1‑65 (MQ=255) caTTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGGCGCTGGTGATTCtgg  >  1:91374/1‑65 (MQ=255) caTTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGGCGCTGGTGATTCtgg  >  1:88629/1‑65 (MQ=255) caTTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGGCGCTGGTGATTCtgg  >  1:538373/1‑65 (MQ=255) caTTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGGCGCTGGTGATTCtgg  >  1:525182/1‑65 (MQ=255) caTTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGGCGCTGGTGATTCtgg  >  1:392943/1‑65 (MQ=255) caTTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGGCGCTGGTGATTCtgg  >  1:379360/1‑65 (MQ=255) caTTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGGCGCTGGTGATTCtgg  >  1:23665/1‑65 (MQ=255) caTTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGGCGCTGGTGATTCtgg  >  1:230358/1‑65 (MQ=255) caTTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGGCGCTGGTGATTCtgg  >  1:1770066/1‑65 (MQ=255) caTTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGGCGCTGGTGATTCtgg  >  1:1040867/1‑65 (MQ=255) caTTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGGCGCTGGTGATTCtgg  >  1:1624029/1‑65 (MQ=255) caTTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGGCGCTGGTGATTCtgg  >  1:1616269/1‑65 (MQ=255) caTTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGGCGCTGGTGATTCtgg  >  1:1571789/1‑65 (MQ=255) caTTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGGCGCTGGTGATTCtgg  >  1:1445953/1‑65 (MQ=255) caTTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGGCGCTGGTGATTCtgg  >  1:143444/1‑65 (MQ=255) caTTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGGCGCTGGTGATTCtgg  >  1:1414540/1‑65 (MQ=255) caTTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGGCGCTGGTGATTCtgg  >  1:1378125/1‑65 (MQ=255) caTTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGGCGCTGGTGATTCtgg  >  1:1354314/1‑65 (MQ=255) caTTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGGCGCTGGTGATTCtgg  >  1:1316131/1‑65 (MQ=255) caTTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGGCGCTGGTGATTCtgg  >  1:1126357/1‑65 (MQ=255) caTTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGGCGCTGGTGATTCtgg  >  1:1110034/1‑65 (MQ=255) caTTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGGCGCTGGTGATTCtgg  >  1:1095583/1‑65 (MQ=255)                                                                 | CATTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGGCGCTGGTGATTCTGG  >  W3110S.gb/2161500‑2161564

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑