Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 2172059 2172112 54 135 [0] [0] 12 gatR
gatR
DNA‑binding transcriptional regulator, N‑ter fragment; ECK2083:JW5340:b2087
DNA‑binding transcriptional regulator; ECK2083:JW5340+JW2074:b4498

Only 100 of 135 total aligned reads displayed.

GGCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCA  >  W3110S.gb/2171995‑2172058
                                                               |
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:1785677/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:237499/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:236505/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:221837/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:196361/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:1876320/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:1856474/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:1850896/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:180799/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:748047/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:179222/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:268799/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:756245/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:774380/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:1737044/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:1726022/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:1695891/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:1689957/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:1688451/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:1683524/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:1662731/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:421857/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:67556/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:660085/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:649327/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:623634/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:579831/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:560365/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:522432/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:699513/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:474962/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:101644/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:419074/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:397478/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:390382/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:376038/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:375298/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:360962/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:351202/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:342887/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:27430/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:1126741/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:1441699/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:1393375/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:1370902/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:793930/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:81735/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:1297407/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:1288279/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:1207231/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:1163382/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:1648281/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:1126738/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:954695/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:111115/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:1107062/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:962454/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:1007884/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:1041934/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:102523/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:165762/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:1620861/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:1617160/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:1605228/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:1593641/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:163068/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:1636586/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:1586369/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:1564838/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:1563758/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:1559774/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:1549524/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:1546769/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:153475/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:1487666/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:1487305/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:1486806/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:1465972/64‑1 (MQ=255)
ggCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAAGACCATTAACCGCa  <  1:252648/64‑1 (MQ=255)
                  gCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:1457330/46‑1 (MQ=255)
                    tAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCTCa  <  1:1630146/44‑1 (MQ=255)
                         gAATAACCTTCATTAAATGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:678332/39‑1 (MQ=255)
                         gAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:71610/39‑1 (MQ=255)
                         gAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:730352/39‑1 (MQ=255)
                         gAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:940377/39‑1 (MQ=255)
                         gAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:996992/39‑1 (MQ=255)
                         gAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:454367/39‑1 (MQ=255)
                         gAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:1795002/39‑1 (MQ=255)
                         gAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:1768002/39‑1 (MQ=255)
                         gAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:1741098/39‑1 (MQ=255)
                         gAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:1324779/39‑1 (MQ=255)
                         gAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:1304057/39‑1 (MQ=255)
                         gAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:1208207/39‑1 (MQ=255)
                            tAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:676156/36‑1 (MQ=255)
                            tAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:487693/36‑1 (MQ=255)
                            tAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:444110/36‑1 (MQ=255)
                            tAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:931923/36‑1 (MQ=255)
                            tAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:106589/36‑1 (MQ=255)
                            tAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCAATAACCGCa  <  1:1062454/36‑1 (MQ=255)
                             aaCCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCa  <  1:1112458/35‑1 (MQ=255)
                                                               |
GGCTGTGACCATCGCACCGCTAATAGAATAACCTTCATTAAAGGTCGTAATACCATTAACCGCA  >  W3110S.gb/2171995‑2172058

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: