Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2188714	2188830	117	38 [0]	[0] 32	thiM/yohL	hydoxyethylthiazole kinase/conserved hypothetical protein

ATAACGTGAAGAAGCAATGACCTGGTGGTCCGTGACTTCCCTACGCTGGCATTATCCAGATCAG  >  W3110S.gb/2188650‑2188713                                                                | aTAACGTGAAGAAGCAATGACCTGGTGGTCCGTGACTTCCCTACGCTGGCATTATCTAGATCAg  <  1:1594333/64‑1 (MQ=255) aTAACGTGAAGAAGCAATGACCTGGTGGTCCGTGACTTCCCTACGCTGGCATTATCCAGATCAg  <  1:636995/64‑1 (MQ=255) aTAACGTGAAGAAGCAATGACCTGGTGGTCCGTGACTTCCCTACGCTGGCATTATCCAGATCAg  <  1:376134/64‑1 (MQ=255) aTAACGTGAAGAAGCAATGACCTGGTGGTCCGTGACTTCCCTACGCTGGCATTATCCAGATCAg  <  1:393394/64‑1 (MQ=255) aTAACGTGAAGAAGCAATGACCTGGTGGTCCGTGACTTCCCTACGCTGGCATTATCCAGATCAg  <  1:447666/64‑1 (MQ=255) aTAACGTGAAGAAGCAATGACCTGGTGGTCCGTGACTTCCCTACGCTGGCATTATCCAGATCAg  <  1:456451/64‑1 (MQ=255) aTAACGTGAAGAAGCAATGACCTGGTGGTCCGTGACTTCCCTACGCTGGCATTATCCAGATCAg  <  1:456983/64‑1 (MQ=255) aTAACGTGAAGAAGCAATGACCTGGTGGTCCGTGACTTCCCTACGCTGGCATTATCCAGATCAg  <  1:538589/64‑1 (MQ=255) aTAACGTGAAGAAGCAATGACCTGGTGGTCCGTGACTTCCCTACGCTGGCATTATCCAGATCAg  <  1:6045/64‑1 (MQ=255) aTAACGTGAAGAAGCAATGACCTGGTGGTCCGTGACTTCCCTACGCTGGCATTATCCAGATCAg  <  1:621765/64‑1 (MQ=255) aTAACGTGAAGAAGCAATGACCTGGTGGTCCGTGACTTCCCTACGCTGGCATTATCCAGATCAg  <  1:319045/64‑1 (MQ=255) aTAACGTGAAGAAGCAATGACCTGGTGGTCCGTGACTTCCCTACGCTGGCATTATCCAGATCAg  <  1:638459/64‑1 (MQ=255) aTAACGTGAAGAAGCAATGACCTGGTGGTCCGTGACTTCCCTACGCTGGCATTATCCAGATCAg  <  1:698606/64‑1 (MQ=255) aTAACGTGAAGAAGCAATGACCTGGTGGTCCGTGACTTCCCTACGCTGGCATTATCCAGATCAg  <  1:700220/64‑1 (MQ=255) aTAACGTGAAGAAGCAATGACCTGGTGGTCCGTGACTTCCCTACGCTGGCATTATCCAGATCAg  <  1:702045/64‑1 (MQ=255) aTAACGTGAAGAAGCAATGACCTGGTGGTCCGTGACTTCCCTACGCTGGCATTATCCAGATCAg  <  1:728169/64‑1 (MQ=255) aTAACGTGAAGAAGCAATGACCTGGTGGTCCGTGACTTCCCTACGCTGGCATTATCCAGATCAg  <  1:73544/64‑1 (MQ=255) aTAACGTGAAGAAGCAATGACCTGGTGGTCCGTGACTTCCCTACGCTGGCATTATCCAGATCAg  <  1:759909/64‑1 (MQ=255) aTAACGTGAAGAAGCAATGACCTGGTGGTCCGTGACTTCCCTACGCTGGCATTATCCAGATCAg  <  1:804265/64‑1 (MQ=255) aTAACGTGAAGAAGCAATGACCTGGTGGTCCGTGACTTCCCTACGCTGGCATTATCCAGATCAg  <  1:804917/64‑1 (MQ=255) aTAACGTGAAGAAGCAATGACCTGGTGGTCCGTGACTTCCCTACGCTGGCATTATCCAGATCAg  <  1:295667/64‑1 (MQ=255) aTAACGTGAAGAAGCAATGACCTGGTGGTCCGTGACTTCCCTACGCTGGCATTATCCAGATCAg  <  1:1141070/64‑1 (MQ=255) aTAACGTGAAGAAGCAATGACCTGGTGGTCCGTGACTTCCCTACGCTGGCATTATCCAGATCAg  <  1:1147741/64‑1 (MQ=255) aTAACGTGAAGAAGCAATGACCTGGTGGTCCGTGACTTCCCTACGCTGGCATTATCCAGATCAg  <  1:1264129/64‑1 (MQ=255) aTAACGTGAAGAAGCAATGACCTGGTGGTCCGTGACTTCCCTACGCTGGCATTATCCAGATCAg  <  1:1267904/64‑1 (MQ=255) aTAACGTGAAGAAGCAATGACCTGGTGGTCCGTGACTTCCCTACGCTGGCATTATCCAGATCAg  <  1:1291745/64‑1 (MQ=255) aTAACGTGAAGAAGCAATGACCTGGTGGTCCGTGACTTCCCTACGCTGGCATTATCCAGATCAg  <  1:1292301/64‑1 (MQ=255) aTAACGTGAAGAAGCAATGACCTGGTGGTCCGTGACTTCCCTACGCTGGCATTATCCAGATCAg  <  1:1335084/64‑1 (MQ=255) aTAACGTGAAGAAGCAATGACCTGGTGGTCCGTGACTTCCCTACGCTGGCATTATCCAGATCAg  <  1:1414260/64‑1 (MQ=255) aTAACGTGAAGAAGCAATGACCTGGTGGTCCGTGACTTCCCTACGCTGGCATTATCCAGATCAg  <  1:1437418/64‑1 (MQ=255) aTAACGTGAAGAAGCAATGACCTGGTGGTCCGTGACTTCCCTACGCTGGCATTATCCAGATCAg  <  1:1570697/64‑1 (MQ=255) aTAACGTGAAGAAGCAATGACCTGGTGGTCCGTGACTTCCCTACGCTGGCATTATCCAGATCAg  <  1:1595681/64‑1 (MQ=255) aTAACGTGAAGAAGCAATGACCTGGTGGTCCGTGACTTCCCTACGCTGGCATTATCCAGATCAg  <  1:1609602/64‑1 (MQ=255) aTAACGTGAAGAAGCAATGACCTGGTGGTCCGTGACTTCCCTACGCTGGCATTATCCAGATCAg  <  1:1727363/64‑1 (MQ=255) aTAACGTGAAGAAGCAATGACCTGGTGGTCCGTGACTTCCCTACGCTGGCATTATCCAGATCAg  <  1:1110816/64‑1 (MQ=255) aTAACGTGAAGAAGCAATGACCTGGTGGTCCATGACTTCCCTACGCTGGCATTATCCAGATCAg  <  1:1280958/64‑1 (MQ=255)               cAATGACCTGGTGGTCCGTGACTTCCCTACGCTGGCATTATCCAGATCAg  <  1:1349102/50‑1 (MQ=255)                       tggtggTCCGTGACTTCCCTACGCTGGCATTATCCAGATCAg  <  1:159549/42‑1 (MQ=255)                                                                | ATAACGTGAAGAAGCAATGACCTGGTGGTCCGTGACTTCCCTACGCTGGCATTATCCAGATCAG  >  W3110S.gb/2188650‑2188713

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑