Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2191562	2191611	50	81 [0]	[0] 8	yehA	predicted fimbrial‑like adhesin protein

TAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGA  >  W3110S.gb/2191497‑2191561                                                                 | tgaatttaatttTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:1847376/63‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:300420/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:500544/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:458989/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:430903/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:428357/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:387715/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:371105/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:362528/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:351000/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:313972/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:513051/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:295390/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:206795/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:194802/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:1825560/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:1724581/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:1719885/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:1719294/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:702820/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:947756/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:916777/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:906781/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:84024/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:794067/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:790493/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:785853/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:753357/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:714261/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:1010517/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:691184/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:653304/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:648578/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:573292/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:561652/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:537843/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:519543/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:519168/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:1228740/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:1425633/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:1424492/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:1378182/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:1377659/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:1366692/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:1347691/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:1325537/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:1263992/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:1259505/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:1695687/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:1217290/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:1202379/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:1198841/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:1187019/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:1166803/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:1151023/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:1060412/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:102856/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:1003681/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:1448137/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:1698410/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:1683887/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:16807/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:165146/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:164656/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:1639348/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:1634942/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:1618121/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:1517039/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:1510044/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:1491507/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:1491505/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:1489698/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:1467695/65‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:1439974/65‑1 (MQ=255)  aaaTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:1093320/64‑1 (MQ=255)  aaaTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:952583/64‑1 (MQ=255)  aaaTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:994265/64‑1 (MQ=255)      ttaatttTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:98022/60‑1 (MQ=255)            ttATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:1663150/54‑1 (MQ=255)                           aaaGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:1873492/39‑1 (MQ=255)                             aGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa  <  1:257406/37‑1 (MQ=255)                                                                 | TAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGA  >  W3110S.gb/2191497‑2191561

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑