Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2195729	2195772	44	64 [0]	[0] 35	yehD/yehE	predicted fimbrial‑like adhesin protein/hypothetical protein

TGATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTA  >  W3110S.gb/2195664‑2195728                                                                 | tGATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATAC‑AAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:1131598/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCACTATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:1708514/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:463146/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:535098/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:426906/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:417303/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:404843/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:391739/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:379632/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:378926/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:358222/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:326578/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:302378/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:299329/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:2986/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:263771/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:261417/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:503834/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:22416/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:548190/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:570773/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:573419/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:621721/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:651315/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:657469/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:691826/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:800137/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:825365/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:946266/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:946783/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:951619/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:966828/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:989505/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:1485708/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:1007243/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:1007533/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:1027418/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:1030050/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:1035666/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:1073052/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:1104502/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:1147859/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:1261516/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:1291127/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:1321060/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:1360056/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:1478399/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:1004317/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:1491079/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:149414/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:1501586/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:1554146/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:1557666/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:1560018/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:1562934/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:1629219/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:1664907/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:171099/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:1713286/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:1763056/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:1864471/64‑1 (MQ=255)  gATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:199284/64‑1 (MQ=255)  gATTCAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:1286380/64‑1 (MQ=255)            aaaTTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTa  <  1:860468/54‑1 (MQ=255)                                                                 | TGATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTA  >  W3110S.gb/2195664‑2195728

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑