Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2216693	2216830	138	85 [0]	[0] 29	yehU	predicted sensory kinase in two‑component system with YehT

TGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAATT  >  W3110S.gb/2216628‑2216692                                                                 | tgcccTGCAACCGCGCCTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:428691/4‑65 (MQ=255) tgcccTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:1410544/4‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:279833/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:394354/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:392282/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:35115/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:340963/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:332743/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:328608/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:303958/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:286270/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:1846261/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:258457/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:246841/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:220651/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:218335/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:200830/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:199505/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:197728/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:1861334/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:185949/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:1798081/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:809958/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:979129/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:961999/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:96194/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:958755/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:956249/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:95487/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:950355/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:924667/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:905293/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:435333/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:802339/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:764240/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:742528/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:70253/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:665730/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:611237/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:609096/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:542049/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:498773/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:1142751/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:1326660/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:1300658/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:1287873/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:1271110/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:1209198/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:1208024/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:1184400/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:1178071/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:116625/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:1164166/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:1343003/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:1138667/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:1138203/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:1116647/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:1096015/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:1072549/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:1061621/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:1045121/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:104345/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:1028865/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:1682834/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:1793751/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:1750420/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:174884/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:1737196/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:1724298/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:1723615/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:1711491/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:1710723/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:1705110/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:1023179/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:1635501/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:1631720/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:1613059/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:1608950/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:1531272/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:1489661/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:1433214/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:1409313/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:1390162/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTGCAAtt  >  1:710796/1‑65 (MQ=255) tGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCACCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt  >  1:1879360/1‑65 (MQ=255)                                                                 | TGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAATT  >  W3110S.gb/2216628‑2216692

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑