Missing coverage evidence...
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CGCCCCGCGCACCACAGGAGTCGTTCCGAGTTGCACTTTATTCACCGTCGGTACGCCGTGGCTTT  >  W3110S.gb/2222606‑2222670                                                                 | cGCCCCGCGCACCACAGGAGTCGTTCCGAGTTGCACTTTATTCACCGTCGGTACGCCGTGGCttt  <  1:1880682/65‑1 (MQ=255) cGCCCCGCGCACCACAGGAGTCGTTCCGAGTTGCACTTTATTCACCGTCGGTACGCCGTGGCttt  <  1:968074/65‑1 (MQ=255) cGCCCCGCGCACCACAGGAGTCGTTCCGAGTTGCACTTTATTCACCGTCGGTACGCCGTGGCttt  <  1:949333/65‑1 (MQ=255) cGCCCCGCGCACCACAGGAGTCGTTCCGAGTTGCACTTTATTCACCGTCGGTACGCCGTGGCttt  <  1:911424/65‑1 (MQ=255) cGCCCCGCGCACCACAGGAGTCGTTCCGAGTTGCACTTTATTCACCGTCGGTACGCCGTGGCttt  <  1:770992/65‑1 (MQ=255) cGCCCCGCGCACCACAGGAGTCGTTCCGAGTTGCACTTTATTCACCGTCGGTACGCCGTGGCttt  <  1:758086/65‑1 (MQ=255) cGCCCCGCGCACCACAGGAGTCGTTCCGAGTTGCACTTTATTCACCGTCGGTACGCCGTGGCttt  <  1:56392/65‑1 (MQ=255) cGCCCCGCGCACCACAGGAGTCGTTCCGAGTTGCACTTTATTCACCGTCGGTACGCCGTGGCttt  <  1:557987/65‑1 (MQ=255) cGCCCCGCGCACCACAGGAGTCGTTCCGAGTTGCACTTTATTCACCGTCGGTACGCCGTGGCttt  <  1:492387/65‑1 (MQ=255) cGCCCCGCGCACCACAGGAGTCGTTCCGAGTTGCACTTTATTCACCGTCGGTACGCCGTGGCttt  <  1:488096/65‑1 (MQ=255) cGCCCCGCGCACCACAGGAGTCGTTCCGAGTTGCACTTTATTCACCGTCGGTACGCCGTGGCttt  <  1:436023/65‑1 (MQ=255) cGCCCCGCGCACCACAGGAGTCGTTCCGAGTTGCACTTTATTCACCGTCGGTACGCCGTGGCttt  <  1:307783/65‑1 (MQ=255) cGCCCCGCGCACCACAGGAGTCGTTCCGAGTTGCACTTTATTCACCGTCGGTACGCCGTGGCttt  <  1:250561/65‑1 (MQ=255) cGCCCCGCGCACCACAGGAGTCGTTCCGAGTTGCACTTTATTCACCGTCGGTACGCCGTGGCttt  <  1:1119868/65‑1 (MQ=255) cGCCCCGCGCACCACAGGAGTCGTTCCGAGTTGCACTTTATTCACCGTCGGTACGCCGTGGCttt  <  1:1859267/65‑1 (MQ=255) cGCCCCGCGCACCACAGGAGTCGTTCCGAGTTGCACTTTATTCACCGTCGGTACGCCGTGGCttt  <  1:1806335/65‑1 (MQ=255) cGCCCCGCGCACCACAGGAGTCGTTCCGAGTTGCACTTTATTCACCGTCGGTACGCCGTGGCttt  <  1:1712124/65‑1 (MQ=255) cGCCCCGCGCACCACAGGAGTCGTTCCGAGTTGCACTTTATTCACCGTCGGTACGCCGTGGCttt  <  1:1652072/65‑1 (MQ=255) cGCCCCGCGCACCACAGGAGTCGTTCCGAGTTGCACTTTATTCACCGTCGGTACGCCGTGGCttt  <  1:1635921/65‑1 (MQ=255) cGCCCCGCGCACCACAGGAGTCGTTCCGAGTTGCACTTTATTCACCGTCGGTACGCCGTGGCttt  <  1:156672/65‑1 (MQ=255) cGCCCCGCGCACCACAGGAGTCGTTCCGAGTTGCACTTTATTCACCGTCGGTACGCCGTGGCttt  <  1:1481251/65‑1 (MQ=255) cGCCCCGCGCACCACAGGAGTCGTTCCGAGTTGCACTTTATTCACCGTCGGTACGCCGTGGCttt  <  1:1399827/65‑1 (MQ=255) cGCCCCGCGCACCACAGGAGTCGTTCCGAGTTGCACTTTATTCACCGTCGGTACGCCGTGGCttt  <  1:1393922/65‑1 (MQ=255) cGCCCCGCGCACCACAGGAGTCGTTCCGAGTTGCACTTTATTCACCGTCGGTACGCCGTGGCttt  <  1:1364016/65‑1 (MQ=255) cGCCCCGCGCACCACAGGAGTCGTTCCGAGTTGCACTTTATTCACCGTCGGTACGCCGTGGCttt  <  1:1345187/65‑1 (MQ=255) cGCCCCGCGCACCACAGGAGTCGTTCCGAGTTGCACTTTATTCACCGTCGGTACGCCGTGGCttt  <  1:1288868/65‑1 (MQ=255) cGCCCCGCGCACCACAGGAGTCGTTCCGAGTTGCACTTTATTCACCGTCGGTACGCCGTGGCttt  <  1:119692/65‑1 (MQ=255) cGCCCCGCGCACCACAGGAGTCGTTCCGAGTAGCACTTTATTCACCGTCGGTACGCCGTGGCttt  <  1:597661/65‑1 (MQ=255)                              gTTGCACTTTATTCACCGTCGGTACGCCGTGGCttt  <  1:646321/36‑1 (MQ=255)                                                                 | CGCCCCGCGCACCACAGGAGTCGTTCCGAGTTGCACTTTATTCACCGTCGGTACGCCGTGGCTTT  >  W3110S.gb/2222606‑2222670

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑