Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2263062	2263119	58	76 [0]	[0] 16	fruA	fused fructose‑specific PTS enzyme IIB'BC components

TTGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACGCTGC  >  W3110S.gb/2262997‑2263061                                                                 | ttGCTCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:1379613/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:421876/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:553347/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:529161/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:514876/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:50155/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:489183/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:487401/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:438255/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:433321/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:595455/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:379756/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:373787/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:34202/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:339460/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:249707/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:220061/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:191938/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:1831417/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:1828644/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:839295/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:998230/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:992386/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:950608/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:938101/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:911909/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:908347/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:890179/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:85285/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:1818315/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:802024/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:793124/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:786132/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:761948/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:704798/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:679666/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:663654/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:654606/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:1176180/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:1006143/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:1447039/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:1412126/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:1387692/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:1354667/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:1319655/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:1295056/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:1203224/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:1195934/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:1460141/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:1174408/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:114354/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:1123049/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:1122224/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:1078751/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:1043914/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:1041961/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:1008147/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:1658345/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:1789188/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:1783183/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:1762282/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:1761347/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:1749287/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:1747641/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:1727853/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:1698134/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:1676386/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:1461846/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:1600903/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:1533928/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:1517168/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:151222/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:1501381/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:1493052/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:1477416/1‑65 (MQ=255) ttGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTCCCCTGTAACACACCTTTTATTACgctgc  >  1:712192/1‑65 (MQ=255)                                                                 | TTGCGCTCATCAAATGTTACAGGACAGGAAATTTCTGCCCTGTAACACACCTTTTATTACGCTGC  >  W3110S.gb/2262997‑2263061

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑