Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2291935	2291988	54	38 [0]	[0] 148	yejO	predicted autotransporter outer membrane protein

CGATAGCGACAAAGACGGCCCCCCCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGT  >  W3110S.gb/2291871‑2291934                                                                | cGATAGCGACAAAGACGGCCCCCCCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGt  >  1:75554/1‑64 (MQ=255) cGATAGCGACAAAGACGGCCCCCCCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGt  >  1:296179/1‑64 (MQ=255) cGATAGCGACAAAGACGGCCCCCCCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGt  >  1:403481/1‑64 (MQ=255) cGATAGCGACAAAGACGGCCCCCCCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGt  >  1:488078/1‑64 (MQ=255) cGATAGCGACAAAGACGGCCCCCCCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGt  >  1:506809/1‑64 (MQ=255) cGATAGCGACAAAGACGGCCCCCCCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGt  >  1:5523/1‑64 (MQ=255) cGATAGCGACAAAGACGGCCCCCCCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGt  >  1:637867/1‑64 (MQ=255) cGATAGCGACAAAGACGGCCCCCCCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGt  >  1:685460/1‑64 (MQ=255) cGATAGCGACAAAGACGGCCCCCCCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGt  >  1:691488/1‑64 (MQ=255) cGATAGCGACAAAGACGGCCCCCCCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGt  >  1:715683/1‑64 (MQ=255) cGATAGCGACAAAGACGGCCCCCCCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGt  >  1:246970/1‑64 (MQ=255) cGATAGCGACAAAGACGGCCCCCCCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGt  >  1:798692/1‑64 (MQ=255) cGATAGCGACAAAGACGGCCCCCCCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGt  >  1:823868/1‑64 (MQ=255) cGATAGCGACAAAGACGGCCCCCCCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGt  >  1:8341/1‑64 (MQ=255) cGATAGCGACAAAGACGGCCCCCCCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGt  >  1:912725/1‑64 (MQ=255) cGATAGCGACAAAGACGGCCCCCCCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGt  >  1:933989/1‑64 (MQ=255) cGATAGCGACAAAGACGGCCCCCCCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGt  >  1:954597/1‑64 (MQ=255) cGATAGCGACAAAGACGGCCCCCCCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGt  >  1:955926/1‑64 (MQ=255) cGATAGCGACAAAGACGGCCCCCCCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGt  >  1:996217/1‑64 (MQ=255) cGATAGCGACAAAGACGGCCCCCCCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGt  >  1:1410591/1‑64 (MQ=255) cGATAGCGACAAAGACGGCCCCCCCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGt  >  1:1118954/1‑64 (MQ=255) cGATAGCGACAAAGACGGCCCCCCCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGt  >  1:1143867/1‑64 (MQ=255) cGATAGCGACAAAGACGGCCCCCCCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGt  >  1:1236761/1‑64 (MQ=255) cGATAGCGACAAAGACGGCCCCCCCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGt  >  1:124349/1‑64 (MQ=255) cGATAGCGACAAAGACGGCCCCCCCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGt  >  1:1263308/1‑64 (MQ=255) cGATAGCGACAAAGACGGCCCCCCCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGt  >  1:129618/1‑64 (MQ=255) cGATAGCGACAAAGACGGCCCCCCCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGt  >  1:1314260/1‑64 (MQ=255) cGATAGCGACAAAGACGGCCCCCCCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGt  >  1:1351903/1‑64 (MQ=255) cGATAGCGACAAAGACGGCCCCCCCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGt  >  1:1090321/1‑64 (MQ=255) cGATAGCGACAAAGACGGCCCCCCCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGt  >  1:1456791/1‑64 (MQ=255) cGATAGCGACAAAGACGGCCCCCCCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGt  >  1:1487615/1‑64 (MQ=255) cGATAGCGACAAAGACGGCCCCCCCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGt  >  1:1527746/1‑64 (MQ=255) cGATAGCGACAAAGACGGCCCCCCCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGt  >  1:1534475/1‑64 (MQ=255) cGATAGCGACAAAGACGGCCCCCCCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGt  >  1:1681451/1‑64 (MQ=255) cGATAGCGACAAAGACGGCCCCCCCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGt  >  1:1698328/1‑64 (MQ=255) cGATAGCGACAAAGACGGCCCCCCCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGt  >  1:1735512/1‑64 (MQ=255) cGATAGCGACAAAGACGGCCCCCCCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGt  >  1:1737260/1‑64 (MQ=255) cGATAGCGACAAAGACGGCCCCCCCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATAGTGGt  >  1:1149795/1‑64 (MQ=255)                                                                | CGATAGCGACAAAGACGGCCCCCCCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGT  >  W3110S.gb/2291871‑2291934

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑