Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	175981	176270	290	74 [0]	[0] 84	clcA	chloride channel, voltage‑gated

AAATGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATGGG  >  W3110S.gb/175917‑175980                                                                | aactGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:1619267/61‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAGTATTACCAAATggg  <  1:276775/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:295919/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:471713/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:471132/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:360053/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:359406/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:344176/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:317104/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:298100/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:477882/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:267059/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:253032/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:233369/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:1860348/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:1850876/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:1094753/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:1824224/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:801916/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:96302/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:952599/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:942456/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:903357/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:823900/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:820121/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:813578/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:812718/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:1825353/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:772132/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:766246/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:752477/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:677243/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:671637/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:584719/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:546449/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:479396/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:1210747/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:1377259/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:1799786/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:1344360/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:1336895/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:1307137/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:1246021/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:1236274/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:1225400/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:1351990/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:1197154/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:1180972/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:1144846/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:1140398/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:1124025/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:110615/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:10963/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:1713114/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:1789712/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:1785506/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:1783827/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:1781637/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:1754587/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:1745917/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:1716406/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:1437961/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:1692737/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:1628129/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:1510899/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:148404/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:1483757/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:1474783/64‑1 (MQ=255) aaaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATagg  <  1:585141/64‑1 (MQ=255)  aaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:664688/63‑1 (MQ=255)  aaTGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:1169721/63‑1 (MQ=255)       gTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:1863015/58‑1 (MQ=255)         gCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:883410/56‑1 (MQ=255)                aTGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATggg  <  1:1642641/49‑1 (MQ=255)                                                                | AAATGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCTGCACCGTGTGCACGGCGGCAATATTACCAAATGGG  >  W3110S.gb/175917‑175980

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑