Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2302149	2303522	1374	99 [0]	[0] 57	[napH]–[napG]	[napH],[napG]

TTGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTG  >  W3110S.gb/2302084‑2302148                                                                 | ttGTAAATTCATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:1102654/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGCCCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:1717377/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCTCGGCTGGTg  >  1:408253/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:547300/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:584696/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:535858/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:527624/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:488623/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:449656/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:442524/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:438859/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:433296/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:425179/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:421463/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:412846/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:40551/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:393928/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:392300/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:388242/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:372589/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:352716/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:340230/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:339603/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:296443/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:291034/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:270947/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:828903/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:998141/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:979523/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:968799/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:949972/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:935778/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:931019/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:913291/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:908354/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:896183/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:867886/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:864952/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:859006/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:55855/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:767312/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:76256/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:757631/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:731227/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:699654/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:698095/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:695498/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:683992/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:636970/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:611487/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:239028/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:1233843/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:1560470/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:1557707/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:154947/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:1546280/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:1459662/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:1399016/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:1342810/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:1315835/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:1265836/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:1242732/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:1240334/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:1578286/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:122658/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:1224645/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:1204768/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:1155007/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:1121981/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:1093838/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:1091976/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:1065179/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:1058041/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:1056927/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:1052676/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:1771065/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:1021583/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:205918/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:204522/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:1841385/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:1817503/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:1809925/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:1807855/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:1807602/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:1804435/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:1801279/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:1788950/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:259742/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:1769730/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:1764679/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:1758629/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:1735374/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:1730278/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:1686461/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:1674632/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:1661859/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:1638299/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:159525/1‑65 (MQ=255) ttGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTg  >  1:1585932/1‑65 (MQ=255)                                                                 | TTGTAAATACATCCTCAGAACAGACATCCACGCAGCGACCGCACGTCATGCAATCGCGGCTGGTG  >  W3110S.gb/2302084‑2302148

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑