Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2318991	2319064	74	39 [0]	[1] 52	rcsD	phosphotransfer intermediate protein in two‑component regulatory system with RcsBC

CGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCC  >  W3110S.gb/2318926‑2318990                                                                 | cgacAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACAccc  >  1:969447/4‑65 (MQ=255) cGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACAccc  >  1:845500/1‑65 (MQ=255) cGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACAccc  >  1:467163/1‑65 (MQ=255) cGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACAccc  >  1:492684/1‑65 (MQ=255) cGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACAccc  >  1:502602/1‑65 (MQ=255) cGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACAccc  >  1:608545/1‑65 (MQ=255) cGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACAccc  >  1:625586/1‑65 (MQ=255) cGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACAccc  >  1:76584/1‑65 (MQ=255) cGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACAccc  >  1:777577/1‑65 (MQ=255) cGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACAccc  >  1:807525/1‑65 (MQ=255) cGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACAccc  >  1:820217/1‑65 (MQ=255) cGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACAccc  >  1:414543/1‑65 (MQ=255) cGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACAccc  >  1:874331/1‑65 (MQ=255) cGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACAccc  >  1:885875/1‑65 (MQ=255) cGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACAccc  >  1:940580/1‑65 (MQ=255) cGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACAccc  >  1:946675/1‑65 (MQ=255) cGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACAccc  >  1:957901/1‑65 (MQ=255) cGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACAccc  >  1:980458/1‑65 (MQ=255) cGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACAccc  >  1:998262/1‑65 (MQ=255) cGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACAccc  >  1:1459657/1‑65 (MQ=255) cGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACAccc  >  1:1057367/1‑65 (MQ=255) cGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACAccc  >  1:1091492/1‑65 (MQ=255) cGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACAccc  >  1:1194110/1‑65 (MQ=255) cGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACAccc  >  1:1215370/1‑65 (MQ=255) cGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACAccc  >  1:1239373/1‑65 (MQ=255) cGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACAccc  >  1:1271792/1‑65 (MQ=255) cGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACAccc  >  1:1349629/1‑65 (MQ=255) cGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACAccc  >  1:1386131/1‑65 (MQ=255) cGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACAccc  >  1:1397851/1‑65 (MQ=255) cGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACAccc  >  1:1007302/1‑65 (MQ=255) cGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACAccc  >  1:1459992/1‑65 (MQ=255) cGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACAccc  >  1:1555367/1‑65 (MQ=255) cGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACAccc  >  1:1663275/1‑65 (MQ=255) cGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACAccc  >  1:233319/1‑65 (MQ=255) cGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACAccc  >  1:252804/1‑65 (MQ=255) cGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACAccc  >  1:270045/1‑65 (MQ=255) cGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACAccc  >  1:291782/1‑65 (MQ=255) cGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACAccc  >  1:300305/1‑65 (MQ=255) cGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAAGTGGGGTGCAACCTGTATCACAccc  >  1:700893/1‑65 (MQ=255)                                                                 | CGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCC  >  W3110S.gb/2318926‑2318990

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑