Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 178751 179286 536 93 [0] [0] 64 [pfs]–[dgt] [pfs],[dgt]

AACAGAACCGTTGATGAAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGTT  >  W3110S.gb/178686‑178750
                                                                |
aaCAGAACCGTTGATGAAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:633249/65‑1 (MQ=255)
aaCAGAACCGTTGATGAAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:435806/65‑1 (MQ=255)
aaCAGAACCGTTGATGAAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:1317254/65‑1 (MQ=255)
aaCAGAACCGTTGATGAAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:1365765/65‑1 (MQ=255)
aaCAGAACCGTTGATGAAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:1408462/65‑1 (MQ=255)
aaCAGAACCGTTGATGAAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:1432851/65‑1 (MQ=255)
aaCAGAACCGTTGATGAAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:734747/65‑1 (MQ=255)
aaCAGAACCGTTGATGAAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:482039/65‑1 (MQ=255)
aaCAGAACCGTTGATGAAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:662310/65‑1 (MQ=255)
aaCAGAACCGTTGATGAAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:155251/65‑1 (MQ=255)
aaCAGAACCGTTGATGAAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:1330286/65‑1 (MQ=255)
aaCAGAACCGTTGATGAAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:1565540/65‑1 (MQ=255)
aaCAGAACCGTTGATGAAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:1580817/65‑1 (MQ=255)
aaCAGAACCGTTGATGAAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:1622719/65‑1 (MQ=255)
aaCAGAACCGTTGATGAAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:622440/65‑1 (MQ=255)
aaCAGAACCGTTGATGAAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:1686952/65‑1 (MQ=255)
aaCAGAACCGTTGATGAAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:1699729/65‑1 (MQ=255)
aaCAGAACCGTTGATGAAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:601343/65‑1 (MQ=255)
aaCAGAACCGTTGATGAAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:1814003/65‑1 (MQ=255)
aaCAGAACCGTTGATGAAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:277189/65‑1 (MQ=255)
aaCAGAACCGTTGATGAAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:1005242/65‑1 (MQ=255)
aaCAGAACCGTTGATGAAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:1037949/65‑1 (MQ=255)
aaCAGAACCGTTGATGAAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:1002023/65‑1 (MQ=255)
aaCAGAACCGTTGATGAAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:979100/65‑1 (MQ=255)
aaCAGAACCGTTGATGAAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:939239/65‑1 (MQ=255)
aaCAGAACCGTTGATGAAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:937325/65‑1 (MQ=255)
aaCAGAACCGTTGATGAAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:279424/65‑1 (MQ=255)
aaCAGAACCGTTGATGAAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:1174583/65‑1 (MQ=255)
aaCAGAACCGTTGATGAAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:747856/65‑1 (MQ=255)
aaCAGAACCGTTGATGAAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:1217922/65‑1 (MQ=255)
aaCAGAACCGTTGATGAAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:1225968/65‑1 (MQ=255)
aaCAGAACCGTTGATGAAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:895855/65‑1 (MQ=255)
aaCAGAACCGTTGATGAAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:1257523/65‑1 (MQ=255)
aaCAGAACCGTTGATGAAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:826099/65‑1 (MQ=255)
 aCAGAACCGTTGATGAAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:1208348/64‑1 (MQ=255)
 aCAGAACCGTTGATGAAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:859104/64‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:502946/53‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:505808/53‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:437778/53‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:995654/53‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:508495/53‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:393541/53‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:514273/53‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:548433/53‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:424110/53‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:613788/53‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:622303/53‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:624870/53‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:655947/53‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:673728/53‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:681233/53‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:737249/53‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:747271/53‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:830464/53‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:901261/53‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:927087/53‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:932162/53‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:1229216/53‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:1488233/53‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:1468515/53‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:1463680/53‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:1448002/53‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:1309057/53‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:1288378/53‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:1273558/53‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:1258449/53‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:1495121/53‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:1226446/53‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:1178553/53‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:114696/53‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:1136785/53‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:1128596/53‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:1088928/53‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:1072945/53‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:1049180/53‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:1829422/53‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:303360/53‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:224778/53‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:19585/53‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:1877024/53‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:1858427/53‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:1850688/53‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:1836737/53‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:334986/53‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:1819064/53‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:1805255/53‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:1756198/53‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:1718683/53‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:1678746/53‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:1602326/53‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:1558705/53‑1 (MQ=255)
            gatgaAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:1500686/53‑1 (MQ=255)
                        gccgcTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGtt  <  1:271147/41‑1 (MQ=255)
                                                                |
AACAGAACCGTTGATGAAAGCGTCGCCGCTAACAATCAGGCCACGTACAGCGTTAAGATTCAGTT  >  W3110S.gb/178686‑178750

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: