Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2324947	2325109	163	57 [0]	[0] 27	atoS	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with AtoC

TGCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATC  >  W3110S.gb/2324882‑2324946                                                                 | tGCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:446472/65‑1 (MQ=255) tGCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:1746871/65‑1 (MQ=255) tGCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:1009507/65‑1 (MQ=255) tGCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:1804776/65‑1 (MQ=255) tGCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:1883731/65‑1 (MQ=255) tGCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:191889/65‑1 (MQ=255) tGCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:193501/65‑1 (MQ=255) tGCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:194478/65‑1 (MQ=255) tGCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:257824/65‑1 (MQ=255) tGCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:274941/65‑1 (MQ=255) tGCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:320269/65‑1 (MQ=255) tGCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:398663/65‑1 (MQ=255) tGCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:425447/65‑1 (MQ=255) tGCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:426385/65‑1 (MQ=255) tGCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:1795476/65‑1 (MQ=255) tGCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:450822/65‑1 (MQ=255) tGCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:533536/65‑1 (MQ=255) tGCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:559587/65‑1 (MQ=255) tGCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:591550/65‑1 (MQ=255) tGCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:649527/65‑1 (MQ=255) tGCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:666452/65‑1 (MQ=255) tGCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:676292/65‑1 (MQ=255) tGCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:684635/65‑1 (MQ=255) tGCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:711431/65‑1 (MQ=255) tGCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:721698/65‑1 (MQ=255) tGCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:920716/65‑1 (MQ=255) tGCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:993683/65‑1 (MQ=255) tGCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:1732796/65‑1 (MQ=255) tGCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:103341/65‑1 (MQ=255) tGCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:1113762/65‑1 (MQ=255) tGCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:1114389/65‑1 (MQ=255) tGCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:1161598/65‑1 (MQ=255) tGCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:1212622/65‑1 (MQ=255) tGCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:1214573/65‑1 (MQ=255) tGCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:1222560/65‑1 (MQ=255) tGCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:124980/65‑1 (MQ=255) tGCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:1271529/65‑1 (MQ=255) tGCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:13357/65‑1 (MQ=255) tGCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:1338165/65‑1 (MQ=255) tGCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:1563502/65‑1 (MQ=255) tGCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:1738780/65‑1 (MQ=255) tGCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:1702832/65‑1 (MQ=255) tGCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:1662673/65‑1 (MQ=255) tGCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:1633374/65‑1 (MQ=255) tGCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:1345335/65‑1 (MQ=255) tGCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:1526782/65‑1 (MQ=255) tGCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:1470064/65‑1 (MQ=255) tGCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:1453073/65‑1 (MQ=255) tGCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:1420109/65‑1 (MQ=255) tGCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:1361209/65‑1 (MQ=255) tGCTTAATCAGGCACTAGGCGAGCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:883424/65‑1 (MQ=255)  gCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:1214709/64‑1 (MQ=255)  gCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:691353/64‑1 (MQ=255)  gCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:494395/64‑1 (MQ=255)  gCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:1381649/64‑1 (MQ=255)               cTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:1146233/51‑1 (MQ=255)                             tGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATc  <  1:883804/37‑1 (MQ=255)                                                                 | TGCTTAATCAGGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATC  >  W3110S.gb/2324882‑2324946

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑