Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 2325248 2325282 35 119 [0] [0] 18 atoS sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with AtoC

Only 100 of 119 total aligned reads displayed.

TTCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCG  >  W3110S.gb/2325183‑2325247
                                                                |
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCTAATGAATTAACCg  <  1:112981/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:1623420/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:593608/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:1834312/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:1813662/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:177975/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:1704013/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:1688079/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:614790/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:1870821/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:1618167/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:1600070/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:1576553/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:1557308/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:1546408/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:717260/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:1539340/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:1479600/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:574795/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:513198/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:439230/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:521546/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:564915/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:362467/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:361400/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:350289/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:340893/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:1865639/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:297573/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:295446/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:290162/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:233096/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:213014/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:209471/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:1484452/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:880375/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:1288902/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:770138/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:784000/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:1227305/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:1167961/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:860010/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:1127113/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:1116069/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:1470736/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:886641/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:889675/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:1072100/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:890902/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:1049393/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:1048094/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:942947/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:1037015/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:741922/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:14737/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:1466802/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:1466315/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:1446373/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:1425795/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:1403341/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:1402573/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:735473/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:1369162/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:1350186/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:747709/65‑1 (MQ=255)
ttCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGCGGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:1229053/65‑1 (MQ=255)
 tCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:638104/64‑1 (MQ=255)
 tCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:673864/64‑1 (MQ=255)
 tCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:848522/64‑1 (MQ=255)
 tCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:735228/64‑1 (MQ=255)
 tCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:596583/64‑1 (MQ=255)
 tCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:1702189/64‑1 (MQ=255)
 tCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:51992/64‑1 (MQ=255)
 tCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:963301/64‑1 (MQ=255)
 tCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:453349/64‑1 (MQ=255)
 tCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:1027381/64‑1 (MQ=255)
 tCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:1074455/64‑1 (MQ=255)
 tCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:108509/64‑1 (MQ=255)
 tCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:1110128/64‑1 (MQ=255)
 tCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:1145839/64‑1 (MQ=255)
 tCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:1235162/64‑1 (MQ=255)
 tCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:1337358/64‑1 (MQ=255)
 tCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:1338824/64‑1 (MQ=255)
 tCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:1457301/64‑1 (MQ=255)
 tCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:1654743/64‑1 (MQ=255)
 tCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:1017860/64‑1 (MQ=255)
 tCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:326358/64‑1 (MQ=255)
 tCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:402522/64‑1 (MQ=255)
 tCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:470980/64‑1 (MQ=255)
           ccATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:1056125/54‑1 (MQ=255)
             aTTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:1585089/52‑1 (MQ=255)
                   cGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:645378/46‑1 (MQ=255)
                     tAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:1644181/44‑1 (MQ=255)
                         ggTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:1040174/40‑1 (MQ=255)
                          gTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:426425/39‑1 (MQ=255)
                           tGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:1266799/38‑1 (MQ=255)
                             aaaTCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:1542558/36‑1 (MQ=255)
                             aaaTCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:1377860/36‑1 (MQ=255)
                             aaaTCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:1226110/36‑1 (MQ=255)
                             aaaTCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg  <  1:1852182/36‑1 (MQ=255)
                                                                |
TTCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCG  >  W3110S.gb/2325183‑2325247

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑