Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2334291	2334723	433	60 [0]	[0] 153	[yfaQ]–[yfaS]	[yfaQ],[yfaS],[yfaS]

TGGTAGGGCTGCTCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACT  >  W3110S.gb/2334226‑2334290                                                                 | tGGTAGGGCTGCTCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:383225/65‑1 (MQ=255) tGGTAGGGCTGCTCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:1772838/65‑1 (MQ=255) tGGTAGGGCTGCTCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:1013510/65‑1 (MQ=255) tGGTAGGGCTGCTCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:1873675/65‑1 (MQ=255) tGGTAGGGCTGCTCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:202662/65‑1 (MQ=255) tGGTAGGGCTGCTCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:237444/65‑1 (MQ=255) tGGTAGGGCTGCTCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:247252/65‑1 (MQ=255) tGGTAGGGCTGCTCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:252891/65‑1 (MQ=255) tGGTAGGGCTGCTCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:260529/65‑1 (MQ=255) tGGTAGGGCTGCTCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:287737/65‑1 (MQ=255) tGGTAGGGCTGCTCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:317160/65‑1 (MQ=255) tGGTAGGGCTGCTCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:318250/65‑1 (MQ=255) tGGTAGGGCTGCTCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:330063/65‑1 (MQ=255) tGGTAGGGCTGCTCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:339755/65‑1 (MQ=255) tGGTAGGGCTGCTCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:1775688/65‑1 (MQ=255) tGGTAGGGCTGCTCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:464124/65‑1 (MQ=255) tGGTAGGGCTGCTCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:482260/65‑1 (MQ=255) tGGTAGGGCTGCTCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:491177/65‑1 (MQ=255) tGGTAGGGCTGCTCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:508497/65‑1 (MQ=255) tGGTAGGGCTGCTCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:546412/65‑1 (MQ=255) tGGTAGGGCTGCTCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:641282/65‑1 (MQ=255) tGGTAGGGCTGCTCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:697160/65‑1 (MQ=255) tGGTAGGGCTGCTCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:713314/65‑1 (MQ=255) tGGTAGGGCTGCTCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:743044/65‑1 (MQ=255) tGGTAGGGCTGCTCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:754302/65‑1 (MQ=255) tGGTAGGGCTGCTCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:755011/65‑1 (MQ=255) tGGTAGGGCTGCTCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:808703/65‑1 (MQ=255) tGGTAGGGCTGCTCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:907928/65‑1 (MQ=255) tGGTAGGGCTGCTCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:1707292/65‑1 (MQ=255) tGGTAGGGCTGCTCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:1047782/65‑1 (MQ=255) tGGTAGGGCTGCTCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:1049680/65‑1 (MQ=255) tGGTAGGGCTGCTCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:1083296/65‑1 (MQ=255) tGGTAGGGCTGCTCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:1168136/65‑1 (MQ=255) tGGTAGGGCTGCTCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:1205513/65‑1 (MQ=255) tGGTAGGGCTGCTCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:1225256/65‑1 (MQ=255) tGGTAGGGCTGCTCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:1261186/65‑1 (MQ=255) tGGTAGGGCTGCTCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:1320376/65‑1 (MQ=255) tGGTAGGGCTGCTCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:1344758/65‑1 (MQ=255) tGGTAGGGCTGCTCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:1402925/65‑1 (MQ=255) tGGTAGGGCTGCTCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:144399/65‑1 (MQ=255) tGGTAGGGCTGCTCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:1447687/65‑1 (MQ=255) tGGTAGGGCTGCTCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:1454788/65‑1 (MQ=255) tGGTAGGGCTGCTCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:1469515/65‑1 (MQ=255) tGGTAGGGCTGCTCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:1734267/65‑1 (MQ=255) tGGTAGGGCTGCTCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:1648764/65‑1 (MQ=255) tGGTAGGGCTGCTCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:1546185/65‑1 (MQ=255) tGGTAGGGCTGCTCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:1546871/65‑1 (MQ=255) tGGTAGGGCTGCTCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:161903/65‑1 (MQ=255) tGGTAGGGCTGCTCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:1578377/65‑1 (MQ=255)  ggTAGGGCTGCTCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:1046465/64‑1 (MQ=255)  ggTAGGGCTGCTCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:314844/64‑1 (MQ=255)  ggTAGGGCTGCTCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:720953/64‑1 (MQ=255)  ggTAGGGCTGCTCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:1385574/64‑1 (MQ=255)         ctgctCCGGTTGATGGGTATCCTCCATCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:1187005/57‑1 (MQ=255)         ctgctCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:1204265/57‑1 (MQ=255)               cGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:1052477/51‑1 (MQ=255)               cGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:25147/51‑1 (MQ=255)                ggTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:612308/50‑1 (MQ=255)                   tGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:125138/47‑1 (MQ=255)                      tGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACt  <  1:1199007/44‑1 (MQ=255)                                                                 | TGGTAGGGCTGCTCCGGTTGATGGGTATCCTCCAGCCAGGCGTAAACATACAGTTTCCACAAACT  >  W3110S.gb/2334226‑2334290

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑