Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2338630	2338742	113	84 [0]	[0] 15	yfaS yfaS	ECK2220:JW2222+JW2221:b4500; hypothetical protein ECK2220:JW2222:b2228; hypothetical protein, N‑ter fragment

AATGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTGAGAAGAG  >  W3110S.gb/2338566‑2338629                                                                | aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTtagaagag  <  1:391920/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:476732/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:648682/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:637605/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:581252/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:558007/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:53368/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:525704/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:522644/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:500630/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:495153/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:481867/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:652999/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:475214/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:473834/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:449698/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:422517/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:411954/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:385777/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:374216/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:1006975/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:799314/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:993110/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:98110/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:958803/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:958572/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:915723/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:852993/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:849601/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:849015/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:83286/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:371465/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:794645/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:791810/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:784833/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:776948/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:756508/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:732254/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:703996/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:690726/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:668492/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:1207195/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:363472/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:145046/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:1448512/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:144659/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:143799/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:1361050/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:1304640/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:1255837/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:1233036/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:1218682/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:1483093/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:120452/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:11865/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:117926/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:1115003/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:1108158/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:1103252/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:1061314/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:1049230/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:1026971/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:1780904/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:331700/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:328453/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:312404/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:311267/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:247350/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:189958/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:1848434/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:1485330/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:1729219/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:1702249/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:1675316/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:1649730/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:163869/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:1626581/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:15977/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGGCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:942191/64‑1 (MQ=255) aatGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGAAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:653923/64‑1 (MQ=255)  atGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:331394/63‑1 (MQ=255)   tGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:1749697/62‑1 (MQ=255)                   tAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:164730/46‑1 (MQ=255)                       tCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTgagaagag  <  1:261110/42‑1 (MQ=255)                                                                | AATGGCATTGCCGAGCTGTAATTCGGGTAACGCCTGAGTCACATTCTGCCGTGACTGAGAAGAG  >  W3110S.gb/2338566‑2338629

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑