Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2396179	2396246	68	93 [0]	[0] 118	[nuoM]	[nuoM]

ACCGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGC  >  W3110S.gb/2396114‑2396178                                                                 | accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:335007/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:500885/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:411801/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:394967/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:388999/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:378746/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:366722/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:35629/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:349832/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:344104/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:502832/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:320512/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:272436/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:267270/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:239984/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:1866343/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:1865013/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:1824635/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:1775132/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:172706/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:83372/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:999941/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:997564/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:98972/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:941391/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:916690/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:880521/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:873357/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:851014/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:840474/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:1031296/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:766267/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:765715/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:754201/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:722108/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:678155/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:640587/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:600511/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:588240/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:587865/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:1313639/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:1524629/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:1545914/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:1568966/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:1569539/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:1522047/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:1605341/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:147994/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:1615244/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:1390141/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:1346043/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:1638535/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:130530/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:1663974/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:1683843/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:1151194/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:1106424/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:1080010/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:1071736/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:1700644/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:1040755/65‑1 (MQ=255) accGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:1010641/65‑1 (MQ=255) accGGCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:558104/65‑1 (MQ=255)  ccGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:1353957/64‑1 (MQ=255)  ccGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:1745122/64‑1 (MQ=255)  ccGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:1702212/64‑1 (MQ=255)  ccGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:1061894/64‑1 (MQ=255)  ccGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:1698503/64‑1 (MQ=255)  ccGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:1690632/64‑1 (MQ=255)  ccGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:239903/64‑1 (MQ=255)  ccGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:1687422/64‑1 (MQ=255)  ccGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:865866/64‑1 (MQ=255)  ccGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:865017/64‑1 (MQ=255)  ccGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:1283996/64‑1 (MQ=255)  ccGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:1645073/64‑1 (MQ=255)  ccGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:325655/64‑1 (MQ=255)  ccGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:766699/64‑1 (MQ=255)  ccGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:482832/64‑1 (MQ=255)  ccGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:1366072/64‑1 (MQ=255)  ccGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:718360/64‑1 (MQ=255)  ccGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:662618/64‑1 (MQ=255)  ccGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:1617583/64‑1 (MQ=255)  ccGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:363831/64‑1 (MQ=255)  ccGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:1520420/64‑1 (MQ=255)  ccGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:562191/64‑1 (MQ=255)  ccGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:1712592/64‑1 (MQ=255)  ccGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:1584971/64‑1 (MQ=255)  ccGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:431308/64‑1 (MQ=255)   cGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:1363568/63‑1 (MQ=255)        aGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:149684/58‑1 (MQ=255)                         ggTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:1633918/41‑1 (MQ=255)                         ggTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:1384009/41‑1 (MQ=255)                               aGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGc  <  1:647730/35‑1 (MQ=255)                                                                 | ACCGTCAAGCCGACGATCAGCAACGGTAGCAGTGCGATCAGGTTTTGTGGAGTTATTGTCATGGC  >  W3110S.gb/2396114‑2396178

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑