Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2409287	2409334	48	47 [0]	[0] 64	[nuoA]	[nuoA]

GGTAACGGTCGTTCTCACCGTTGGGATCTATGCGGGTGAGCGTATAATCCATCTT  >  W3110S.gb/2409232‑2409286                                                       | ggTAACGGTCGTTCTCACCGTTGGGATCTATGCGGGTGAGCGTATAATCCATCtt  <  1:594007/55‑1 (MQ=255) ggTAACGGTCGTTCTCACCGTTGGGATCTATGCGGGTGAGCGTATAATCCATCtt  <  1:1857946/55‑1 (MQ=255) ggTAACGGTCGTTCTCACCGTTGGGATCTATGCGGGTGAGCGTATAATCCATCtt  <  1:200909/55‑1 (MQ=255) ggTAACGGTCGTTCTCACCGTTGGGATCTATGCGGGTGAGCGTATAATCCATCtt  <  1:227547/55‑1 (MQ=255) ggTAACGGTCGTTCTCACCGTTGGGATCTATGCGGGTGAGCGTATAATCCATCtt  <  1:279531/55‑1 (MQ=255) ggTAACGGTCGTTCTCACCGTTGGGATCTATGCGGGTGAGCGTATAATCCATCtt  <  1:287120/55‑1 (MQ=255) ggTAACGGTCGTTCTCACCGTTGGGATCTATGCGGGTGAGCGTATAATCCATCtt  <  1:338163/55‑1 (MQ=255) ggTAACGGTCGTTCTCACCGTTGGGATCTATGCGGGTGAGCGTATAATCCATCtt  <  1:363532/55‑1 (MQ=255) ggTAACGGTCGTTCTCACCGTTGGGATCTATGCGGGTGAGCGTATAATCCATCtt  <  1:439245/55‑1 (MQ=255) ggTAACGGTCGTTCTCACCGTTGGGATCTATGCGGGTGAGCGTATAATCCATCtt  <  1:490537/55‑1 (MQ=255) ggTAACGGTCGTTCTCACCGTTGGGATCTATGCGGGTGAGCGTATAATCCATCtt  <  1:544913/55‑1 (MQ=255) ggTAACGGTCGTTCTCACCGTTGGGATCTATGCGGGTGAGCGTATAATCCATCtt  <  1:570540/55‑1 (MQ=255) ggTAACGGTCGTTCTCACCGTTGGGATCTATGCGGGTGAGCGTATAATCCATCtt  <  1:1075664/55‑1 (MQ=255) ggTAACGGTCGTTCTCACCGTTGGGATCTATGCGGGTGAGCGTATAATCCATCtt  <  1:605135/55‑1 (MQ=255) ggTAACGGTCGTTCTCACCGTTGGGATCTATGCGGGTGAGCGTATAATCCATCtt  <  1:62262/55‑1 (MQ=255) ggTAACGGTCGTTCTCACCGTTGGGATCTATGCGGGTGAGCGTATAATCCATCtt  <  1:628546/55‑1 (MQ=255) ggTAACGGTCGTTCTCACCGTTGGGATCTATGCGGGTGAGCGTATAATCCATCtt  <  1:63520/55‑1 (MQ=255) ggTAACGGTCGTTCTCACCGTTGGGATCTATGCGGGTGAGCGTATAATCCATCtt  <  1:671055/55‑1 (MQ=255) ggTAACGGTCGTTCTCACCGTTGGGATCTATGCGGGTGAGCGTATAATCCATCtt  <  1:733632/55‑1 (MQ=255) ggTAACGGTCGTTCTCACCGTTGGGATCTATGCGGGTGAGCGTATAATCCATCtt  <  1:783991/55‑1 (MQ=255) ggTAACGGTCGTTCTCACCGTTGGGATCTATGCGGGTGAGCGTATAATCCATCtt  <  1:79820/55‑1 (MQ=255) ggTAACGGTCGTTCTCACCGTTGGGATCTATGCGGGTGAGCGTATAATCCATCtt  <  1:835999/55‑1 (MQ=255) ggTAACGGTCGTTCTCACCGTTGGGATCTATGCGGGTGAGCGTATAATCCATCtt  <  1:89209/55‑1 (MQ=255) ggTAACGGTCGTTCTCACCGTTGGGATCTATGCGGGTGAGCGTATAATCCATCtt  <  1:1808509/55‑1 (MQ=255) ggTAACGGTCGTTCTCACCGTTGGGATCTATGCGGGTGAGCGTATAATCCATCtt  <  1:1053224/55‑1 (MQ=255) ggTAACGGTCGTTCTCACCGTTGGGATCTATGCGGGTGAGCGTATAATCCATCtt  <  1:1077163/55‑1 (MQ=255) ggTAACGGTCGTTCTCACCGTTGGGATCTATGCGGGTGAGCGTATAATCCATCtt  <  1:1091659/55‑1 (MQ=255) ggTAACGGTCGTTCTCACCGTTGGGATCTATGCGGGTGAGCGTATAATCCATCtt  <  1:1137483/55‑1 (MQ=255) ggTAACGGTCGTTCTCACCGTTGGGATCTATGCGGGTGAGCGTATAATCCATCtt  <  1:1140742/55‑1 (MQ=255) ggTAACGGTCGTTCTCACCGTTGGGATCTATGCGGGTGAGCGTATAATCCATCtt  <  1:1144176/55‑1 (MQ=255) ggTAACGGTCGTTCTCACCGTTGGGATCTATGCGGGTGAGCGTATAATCCATCtt  <  1:1158078/55‑1 (MQ=255) ggTAACGGTCGTTCTCACCGTTGGGATCTATGCGGGTGAGCGTATAATCCATCtt  <  1:1159422/55‑1 (MQ=255) ggTAACGGTCGTTCTCACCGTTGGGATCTATGCGGGTGAGCGTATAATCCATCtt  <  1:1177271/55‑1 (MQ=255) ggTAACGGTCGTTCTCACCGTTGGGATCTATGCGGGTGAGCGTATAATCCATCtt  <  1:1301426/55‑1 (MQ=255) ggTAACGGTCGTTCTCACCGTTGGGATCTATGCGGGTGAGCGTATAATCCATCtt  <  1:1389047/55‑1 (MQ=255) ggTAACGGTCGTTCTCACCGTTGGGATCTATGCGGGTGAGCGTATAATCCATCtt  <  1:1410409/55‑1 (MQ=255) ggTAACGGTCGTTCTCACCGTTGGGATCTATGCGGGTGAGCGTATAATCCATCtt  <  1:1504822/55‑1 (MQ=255) ggTAACGGTCGTTCTCACCGTTGGGATCTATGCGGGTGAGCGTATAATCCATCtt  <  1:152451/55‑1 (MQ=255) ggTAACGGTCGTTCTCACCGTTGGGATCTATGCGGGTGAGCGTATAATCCATCtt  <  1:153276/55‑1 (MQ=255) ggTAACGGTCGTTCTCACCGTTGGGATCTATGCGGGTGAGCGTATAATCCATCtt  <  1:1534308/55‑1 (MQ=255) ggTAACGGTCGTTCTCACCGTTGGGATCTATGCGGGTGAGCGTATAATCCATCtt  <  1:1593711/55‑1 (MQ=255) ggTAACGGTCGTTCTCACCGTTGGGATCTATGCGGGTGAGCGTATAATCCATCtt  <  1:1663369/55‑1 (MQ=255) ggTAACGGTCGTTCTCACCGTTGGGATCTATGCGGGTGAGCGTATAATCCATCtt  <  1:1738647/55‑1 (MQ=255) ggTAACGGGCGTTCTCACCGTTGGGATCTATGCGGGTGAGCGTATAATCCATCtt  <  1:1351207/55‑1 (MQ=255)   tAACGGTCGTTCTCACCGTTGGGATCTATGCGGGTGAGCGTATAATCCATCtt  <  1:136204/53‑1 (MQ=255)    aaCGGTCGTTCTCACCGTTGGGATCTATGCGGGTGAGCGTATAATCCATCtt  <  1:824981/52‑1 (MQ=255)                     ttGGGATCTATGCGGGTGAGCGTATAATCCATCtt  <  1:1848389/35‑1 (MQ=255)                                                       | GGTAACGGTCGTTCTCACCGTTGGGATCTATGCGGGTGAGCGTATAATCCATCTT  >  W3110S.gb/2409232‑2409286

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑