Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2440538	2440686	149	27 [0]	[0] 36	truA	pseudouridylate synthase I

CGCTTTAATATCTACCACCACATAAGGACCGTGACGCGTGACA  >  W3110S.gb/2440495‑2440537                                           | cGCTTTAATATCTACCACCACATAAGGACCGTGACGCGTGACa  <  1:1831925/43‑1 (MQ=255) cGCTTTAATATCTACCACCACATAAGGACCGTGACGCGTGACa  <  1:943169/43‑1 (MQ=255) cGCTTTAATATCTACCACCACATAAGGACCGTGACGCGTGACa  <  1:869279/43‑1 (MQ=255) cGCTTTAATATCTACCACCACATAAGGACCGTGACGCGTGACa  <  1:747817/43‑1 (MQ=255) cGCTTTAATATCTACCACCACATAAGGACCGTGACGCGTGACa  <  1:61335/43‑1 (MQ=255) cGCTTTAATATCTACCACCACATAAGGACCGTGACGCGTGACa  <  1:511552/43‑1 (MQ=255) cGCTTTAATATCTACCACCACATAAGGACCGTGACGCGTGACa  <  1:49583/43‑1 (MQ=255) cGCTTTAATATCTACCACCACATAAGGACCGTGACGCGTGACa  <  1:47383/43‑1 (MQ=255) cGCTTTAATATCTACCACCACATAAGGACCGTGACGCGTGACa  <  1:47070/43‑1 (MQ=255) cGCTTTAATATCTACCACCACATAAGGACCGTGACGCGTGACa  <  1:438428/43‑1 (MQ=255) cGCTTTAATATCTACCACCACATAAGGACCGTGACGCGTGACa  <  1:346915/43‑1 (MQ=255) cGCTTTAATATCTACCACCACATAAGGACCGTGACGCGTGACa  <  1:326445/43‑1 (MQ=255) cGCTTTAATATCTACCACCACATAAGGACCGTGACGCGTGACa  <  1:1848595/43‑1 (MQ=255) cGCTTTAATATCTACCACCACATAAGGACCGTGACGCGTGACa  <  1:1033024/43‑1 (MQ=255) cGCTTTAATATCTACCACCACATAAGGACCGTGACGCGTGACa  <  1:1813024/43‑1 (MQ=255) cGCTTTAATATCTACCACCACATAAGGACCGTGACGCGTGACa  <  1:1721404/43‑1 (MQ=255) cGCTTTAATATCTACCACCACATAAGGACCGTGACGCGTGACa  <  1:1681336/43‑1 (MQ=255) cGCTTTAATATCTACCACCACATAAGGACCGTGACGCGTGACa  <  1:1603669/43‑1 (MQ=255) cGCTTTAATATCTACCACCACATAAGGACCGTGACGCGTGACa  <  1:1578672/43‑1 (MQ=255) cGCTTTAATATCTACCACCACATAAGGACCGTGACGCGTGACa  <  1:1451876/43‑1 (MQ=255) cGCTTTAATATCTACCACCACATAAGGACCGTGACGCGTGACa  <  1:1446214/43‑1 (MQ=255) cGCTTTAATATCTACCACCACATAAGGACCGTGACGCGTGACa  <  1:1392050/43‑1 (MQ=255) cGCTTTAATATCTACCACCACATAAGGACCGTGACGCGTGACa  <  1:1170373/43‑1 (MQ=255) cGCTTTAATATCTACCACCACATAAGGACCGTGACGCGTGACa  <  1:1115586/43‑1 (MQ=255) cGCTTTAATATCTACCACCACATAAGGACCGTGACGCGTGACa  <  1:1066769/43‑1 (MQ=255) cGCTTTAATATCTACCACCACATAAGGACCGTGACGCGCGACa  <  1:486765/43‑1 (MQ=255)  gCTTTAATATCTACCACCACATAAGGACCGTGACGCGTGACa  <  1:1336749/42‑1 (MQ=255)                                           | CGCTTTAATATCTACCACCACATAAGGACCGTGACGCGTGACA  >  W3110S.gb/2440495‑2440537

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑