Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2449056	2449388	333	51 [0]	[0] 9	[trmC]–[yfcL]	[trmC],[yfcL]

GGAGCAGAAAGATGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAG  >  W3110S.gb/2448991‑2449055                                                                 | ggAGCAGAAAGATGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTTACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAg  >  1:1274239/1‑65 (MQ=255) ggAGCAGAAAGATGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTTACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAg  >  1:1711331/1‑65 (MQ=255) ggAGCAGAAAGATGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGCTCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAg  >  1:1784303/1‑65 (MQ=255) ggAGCAGAAAGATGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGGGTTAg  >  1:1562243/1‑65 (MQ=255) ggAGCAGAAAGATGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAg  >  1:335217/1‑65 (MQ=255) ggAGCAGAAAGATGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAg  >  1:245659/1‑65 (MQ=255) ggAGCAGAAAGATGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAg  >  1:347657/1‑65 (MQ=255) ggAGCAGAAAGATGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAg  >  1:348888/1‑65 (MQ=255) ggAGCAGAAAGATGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAg  >  1:408592/1‑65 (MQ=255) ggAGCAGAAAGATGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAg  >  1:413546/1‑65 (MQ=255) ggAGCAGAAAGATGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAg  >  1:432132/1‑65 (MQ=255) ggAGCAGAAAGATGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAg  >  1:443105/1‑65 (MQ=255) ggAGCAGAAAGATGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAg  >  1:482019/1‑65 (MQ=255) ggAGCAGAAAGATGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAg  >  1:54824/1‑65 (MQ=255) ggAGCAGAAAGATGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAg  >  1:556268/1‑65 (MQ=255) ggAGCAGAAAGATGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAg  >  1:563298/1‑65 (MQ=255) ggAGCAGAAAGATGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAg  >  1:564631/1‑65 (MQ=255) ggAGCAGAAAGATGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAg  >  1:651746/1‑65 (MQ=255) ggAGCAGAAAGATGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAg  >  1:689790/1‑65 (MQ=255) ggAGCAGAAAGATGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAg  >  1:773285/1‑65 (MQ=255) ggAGCAGAAAGATGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAg  >  1:806005/1‑65 (MQ=255) ggAGCAGAAAGATGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAg  >  1:806114/1‑65 (MQ=255) ggAGCAGAAAGATGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAg  >  1:90193/1‑65 (MQ=255) ggAGCAGAAAGATGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAg  >  1:919775/1‑65 (MQ=255) ggAGCAGAAAGATGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAg  >  1:934422/1‑65 (MQ=255) ggAGCAGAAAGATGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAg  >  1:975939/1‑65 (MQ=255) ggAGCAGAAAGATGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAg  >  1:997892/1‑65 (MQ=255) ggAGCAGAAAGATGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAg  >  1:1485737/1‑65 (MQ=255) ggAGCAGAAAGATGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAg  >  1:1141571/1‑65 (MQ=255) ggAGCAGAAAGATGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAg  >  1:1228761/1‑65 (MQ=255) ggAGCAGAAAGATGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAg  >  1:1390339/1‑65 (MQ=255) ggAGCAGAAAGATGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAg  >  1:139165/1‑65 (MQ=255) ggAGCAGAAAGATGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAg  >  1:1391735/1‑65 (MQ=255) ggAGCAGAAAGATGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAg  >  1:1393998/1‑65 (MQ=255) ggAGCAGAAAGATGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAg  >  1:1415816/1‑65 (MQ=255) ggAGCAGAAAGATGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAg  >  1:142615/1‑65 (MQ=255) ggAGCAGAAAGATGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAg  >  1:144355/1‑65 (MQ=255) ggAGCAGAAAGATGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAg  >  1:147636/1‑65 (MQ=255) ggAGCAGAAAGATGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAg  >  1:334386/1‑65 (MQ=255) ggAGCAGAAAGATGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAg  >  1:1582318/1‑65 (MQ=255) ggAGCAGAAAGATGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAg  >  1:1623300/1‑65 (MQ=255) ggAGCAGAAAGATGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAg  >  1:165837/1‑65 (MQ=255) ggAGCAGAAAGATGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAg  >  1:1674880/1‑65 (MQ=255) ggAGCAGAAAGATGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAg  >  1:1765783/1‑65 (MQ=255) ggAGCAGAAAGATGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAg  >  1:1776168/1‑65 (MQ=255) ggAGCAGAAAGATGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAg  >  1:1777265/1‑65 (MQ=255) ggAGCAGAAAGATGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAg  >  1:1872034/1‑65 (MQ=255) ggAGCAGAAAGATGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAg  >  1:23963/1‑65 (MQ=255) ggAGCAGAAAGATGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAg  >  1:1114426/1‑65 (MQ=255) ggAGCAGAAAGATGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAg  >  1:311645/1‑65 (MQ=255) ggAGCAGAAAGATGAGGCGGTAAGCGCGCCGGGTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAg  >  1:918086/1‑65 (MQ=255)                                                                 | GGAGCAGAAAGATGAGGCGGTAAGCGCGCCGGTTTTTGACGATCTCTTTATGTTTGCGGCTTTAG  >  W3110S.gb/2448991‑2449055

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑