Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2473015	2473151	137	80 [0]	[0] 35	[intS]	[intS]

GAAAGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCCTGCTG  >  W3110S.gb/2472951‑2473014                                                                | gAAAGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:641080/64‑1 (MQ=255) gAAAGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:1635394/64‑1 (MQ=255) gAAAGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:689180/64‑1 (MQ=255)   aaGTGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:468129/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTGAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:32212/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACTAGCACGAATGGCctgctg  <  1:1012556/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCATGAATGGCctgctg  <  1:1610542/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:469403/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:643180/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:601378/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:593213/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:553844/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:549657/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:541278/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:672622/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:44232/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:424720/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:305145/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:249884/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:248549/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:101001/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:745466/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:984641/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:969383/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:924801/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:887975/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:866033/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:772394/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:759943/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:752498/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:666283/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:706827/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:689892/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:689736/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:687985/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:687589/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:685497/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:678057/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:245921/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:1250346/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:241746/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:1465326/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:1452800/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:1446455/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:1435519/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:1424431/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:1385317/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:1367451/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:1292066/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:1503833/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:121341/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:1201493/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:1193792/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:1185053/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:1173523/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:1073855/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:1049624/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:1029060/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:1011529/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:1585615/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:241219/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:197312/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:193599/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:183730/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:1836949/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:1761834/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:171908/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:167375/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:1653404/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:1645505/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:1633320/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:1623180/62‑1 (MQ=255)   aaGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:1560051/62‑1 (MQ=255)    aGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:40791/61‑1 (MQ=255)     gCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:1857157/60‑1 (MQ=255)     gCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:944603/60‑1 (MQ=255)          cACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:498353/55‑1 (MQ=255)          cACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:788012/55‑1 (MQ=255)             ggATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:453859/52‑1 (MQ=255)             ggATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCctgctg  <  1:1766818/52‑1 (MQ=255)                                                                | GAAAGCGGTCACGGATTCAGGCATGAATTCAGCACGATTATGAACGAGCACGAATGGCCTGCTG  >  W3110S.gb/2472951‑2473014

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑