Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	197673	197925	253	42 [0]	[0] 172	[yaeL]	[yaeL]

CTGAACAACCTCAGTGGGCCGATCTCTATCGCCAAGGGGGCTGGGATGACAGCGGAACTCGGGGT  >  W3110S.gb/197608‑197672                                                                 | cTGAACACCCTCAGTGGGCCGATCTCTATCGCCAAGGGGGCTGGGATGACAGCGGAACTCGGGgt  <  1:641648/65‑1 (MQ=255) cTGAACAACCTCAGTGGGCCGATCTCTATCGCCAAGGGGGCTGGGATGACAGCGGAACTCGGGgt  <  1:444020/65‑1 (MQ=255) cTGAACAACCTCAGTGGGCCGATCTCTATCGCCAAGGGGGCTGGGATGACAGCGGAACTCGGGgt  <  1:1861885/65‑1 (MQ=255) cTGAACAACCTCAGTGGGCCGATCTCTATCGCCAAGGGGGCTGGGATGACAGCGGAACTCGGGgt  <  1:1008373/65‑1 (MQ=255) cTGAACAACCTCAGTGGGCCGATCTCTATCGCCAAGGGGGCTGGGATGACAGCGGAACTCGGGgt  <  1:254466/65‑1 (MQ=255) cTGAACAACCTCAGTGGGCCGATCTCTATCGCCAAGGGGGCTGGGATGACAGCGGAACTCGGGgt  <  1:298057/65‑1 (MQ=255) cTGAACAACCTCAGTGGGCCGATCTCTATCGCCAAGGGGGCTGGGATGACAGCGGAACTCGGGgt  <  1:316552/65‑1 (MQ=255) cTGAACAACCTCAGTGGGCCGATCTCTATCGCCAAGGGGGCTGGGATGACAGCGGAACTCGGGgt  <  1:335573/65‑1 (MQ=255) cTGAACAACCTCAGTGGGCCGATCTCTATCGCCAAGGGGGCTGGGATGACAGCGGAACTCGGGgt  <  1:381466/65‑1 (MQ=255) cTGAACAACCTCAGTGGGCCGATCTCTATCGCCAAGGGGGCTGGGATGACAGCGGAACTCGGGgt  <  1:422191/65‑1 (MQ=255) cTGAACAACCTCAGTGGGCCGATCTCTATCGCCAAGGGGGCTGGGATGACAGCGGAACTCGGGgt  <  1:44343/65‑1 (MQ=255) cTGAACAACCTCAGTGGGCCGATCTCTATCGCCAAGGGGGCTGGGATGACAGCGGAACTCGGGgt  <  1:1854399/65‑1 (MQ=255) cTGAACAACCTCAGTGGGCCGATCTCTATCGCCAAGGGGGCTGGGATGACAGCGGAACTCGGGgt  <  1:446460/65‑1 (MQ=255) cTGAACAACCTCAGTGGGCCGATCTCTATCGCCAAGGGGGCTGGGATGACAGCGGAACTCGGGgt  <  1:479117/65‑1 (MQ=255) cTGAACAACCTCAGTGGGCCGATCTCTATCGCCAAGGGGGCTGGGATGACAGCGGAACTCGGGgt  <  1:492893/65‑1 (MQ=255) cTGAACAACCTCAGTGGGCCGATCTCTATCGCCAAGGGGGCTGGGATGACAGCGGAACTCGGGgt  <  1:507871/65‑1 (MQ=255) cTGAACAACCTCAGTGGGCCGATCTCTATCGCCAAGGGGGCTGGGATGACAGCGGAACTCGGGgt  <  1:509370/65‑1 (MQ=255) cTGAACAACCTCAGTGGGCCGATCTCTATCGCCAAGGGGGCTGGGATGACAGCGGAACTCGGGgt  <  1:581934/65‑1 (MQ=255) cTGAACAACCTCAGTGGGCCGATCTCTATCGCCAAGGGGGCTGGGATGACAGCGGAACTCGGGgt  <  1:628112/65‑1 (MQ=255) cTGAACAACCTCAGTGGGCCGATCTCTATCGCCAAGGGGGCTGGGATGACAGCGGAACTCGGGgt  <  1:843114/65‑1 (MQ=255) cTGAACAACCTCAGTGGGCCGATCTCTATCGCCAAGGGGGCTGGGATGACAGCGGAACTCGGGgt  <  1:1480700/65‑1 (MQ=255) cTGAACAACCTCAGTGGGCCGATCTCTATCGCCAAGGGGGCTGGGATGACAGCGGAACTCGGGgt  <  1:1117820/65‑1 (MQ=255) cTGAACAACCTCAGTGGGCCGATCTCTATCGCCAAGGGGGCTGGGATGACAGCGGAACTCGGGgt  <  1:117885/65‑1 (MQ=255) cTGAACAACCTCAGTGGGCCGATCTCTATCGCCAAGGGGGCTGGGATGACAGCGGAACTCGGGgt  <  1:1210776/65‑1 (MQ=255) cTGAACAACCTCAGTGGGCCGATCTCTATCGCCAAGGGGGCTGGGATGACAGCGGAACTCGGGgt  <  1:1335237/65‑1 (MQ=255) cTGAACAACCTCAGTGGGCCGATCTCTATCGCCAAGGGGGCTGGGATGACAGCGGAACTCGGGgt  <  1:1365616/65‑1 (MQ=255) cTGAACAACCTCAGTGGGCCGATCTCTATCGCCAAGGGGGCTGGGATGACAGCGGAACTCGGGgt  <  1:1372550/65‑1 (MQ=255) cTGAACAACCTCAGTGGGCCGATCTCTATCGCCAAGGGGGCTGGGATGACAGCGGAACTCGGGgt  <  1:139803/65‑1 (MQ=255) cTGAACAACCTCAGTGGGCCGATCTCTATCGCCAAGGGGGCTGGGATGACAGCGGAACTCGGGgt  <  1:1399617/65‑1 (MQ=255) cTGAACAACCTCAGTGGGCCGATCTCTATCGCCAAGGGGGCTGGGATGACAGCGGAACTCGGGgt  <  1:1461269/65‑1 (MQ=255) cTGAACAACCTCAGTGGGCCGATCTCTATCGCCAAGGGGGCTGGGATGACAGCGGAACTCGGGgt  <  1:875846/65‑1 (MQ=255) cTGAACAACCTCAGTGGGCCGATCTCTATCGCCAAGGGGGCTGGGATGACAGCGGAACTCGGGgt  <  1:1622230/65‑1 (MQ=255) cTGAACAACCTCAGTGGGCCGATCTCTATCGCCAAGGGGGCTGGGATGACAGCGGAACTCGGGgt  <  1:1654941/65‑1 (MQ=255) cTGAACAACCTCAGTGGGCCGATCTCTATCGCCAAGGGGGCTGGGATGACAGCGGAACTCGGGgt  <  1:1679518/65‑1 (MQ=255) cTGAACAACCTCAGTGGGCCGATCTCTATCGCCAAGGGGGCTGGGATGACAGCGGAACTCGGGgt  <  1:856044/65‑1 (MQ=255) cTGAACAACCTCAGTGGGCCGATCTCTATCGCCAAGGGGGCTGGGATGACAGCGGAACTCGGGgt  <  1:1762664/65‑1 (MQ=255) cTGAACAACCTCAGTGGGCCGATCTCTATCGCCAAGGGGGCTGGGATGACAGCGGAACTCGGGgt  <  1:1799716/65‑1 (MQ=255) cTGAACAACCTCAGTGGGCCGATCTCTATCGCCAAGGGGGCTGGGATGACAGCGGAACTCGGGgt  <  1:1847203/65‑1 (MQ=255) cTGAACAACCTCAGTGGGCCGATCTCTATCGCCAAGGGGGCTGGGATGACAGCGGAACTCGGCgt  <  1:240265/65‑1 (MQ=255) cTGAACAACCTCAGTGGGCCGATCTCTATCCCCAAGGGGGCTGGGATGACAGCGGAACTCGGGgt  <  1:909528/65‑1 (MQ=255) cTGAACAACCTCAGTGGGCCGATATCTATCGCCAAGGGGGCTGGGATGACAGCGGAACTCGGGgt  <  1:1750827/65‑1 (MQ=255)                gggCCGATCTCTATCGCCAAGGGGGCTGGGATGACAGCGGAACTCGGGgt  <  1:1570956/50‑1 (MQ=255)                                                                 | CTGAACAACCTCAGTGGGCCGATCTCTATCGCCAAGGGGGCTGGGATGACAGCGGAACTCGGGGT  >  W3110S.gb/197608‑197672

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑