Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2530320	2530329	10	53 [0]	[0] 78	[xapA]	[xapA]

ATCAGGTTTATAAGTCTTGATAATATCTATGCAAAACAGCGGGTTATGAGAAAATTGAACCTGA  >  W3110S.gb/2530256‑2530319                                                                | aTCAGGTTTATAAGTCTTGATAATATCTATGCAAAACAGCGGGTTATGAGAAAATTGAACCTga  <  1:529092/64‑1 (MQ=255) aTCAGGTTTATAAGTCTTGATAATATCTATGCAAAACAGCGGGTTATGAGAAAATTGAACCTga  <  1:1007745/64‑1 (MQ=255) aTCAGGTTTATAAGTCTTGATAATATCTATGCAAAACAGCGGGTTATGAGAAAATTGAACCTga  <  1:1867289/64‑1 (MQ=255) aTCAGGTTTATAAGTCTTGATAATATCTATGCAAAACAGCGGGTTATGAGAAAATTGAACCTga  <  1:203499/64‑1 (MQ=255) aTCAGGTTTATAAGTCTTGATAATATCTATGCAAAACAGCGGGTTATGAGAAAATTGAACCTga  <  1:212014/64‑1 (MQ=255) aTCAGGTTTATAAGTCTTGATAATATCTATGCAAAACAGCGGGTTATGAGAAAATTGAACCTga  <  1:23100/64‑1 (MQ=255) aTCAGGTTTATAAGTCTTGATAATATCTATGCAAAACAGCGGGTTATGAGAAAATTGAACCTga  <  1:237960/64‑1 (MQ=255) aTCAGGTTTATAAGTCTTGATAATATCTATGCAAAACAGCGGGTTATGAGAAAATTGAACCTga  <  1:254426/64‑1 (MQ=255) aTCAGGTTTATAAGTCTTGATAATATCTATGCAAAACAGCGGGTTATGAGAAAATTGAACCTga  <  1:30270/64‑1 (MQ=255) aTCAGGTTTATAAGTCTTGATAATATCTATGCAAAACAGCGGGTTATGAGAAAATTGAACCTga  <  1:369964/64‑1 (MQ=255) aTCAGGTTTATAAGTCTTGATAATATCTATGCAAAACAGCGGGTTATGAGAAAATTGAACCTga  <  1:385755/64‑1 (MQ=255) aTCAGGTTTATAAGTCTTGATAATATCTATGCAAAACAGCGGGTTATGAGAAAATTGAACCTga  <  1:407707/64‑1 (MQ=255) aTCAGGTTTATAAGTCTTGATAATATCTATGCAAAACAGCGGGTTATGAGAAAATTGAACCTga  <  1:1852524/64‑1 (MQ=255) aTCAGGTTTATAAGTCTTGATAATATCTATGCAAAACAGCGGGTTATGAGAAAATTGAACCTga  <  1:541365/64‑1 (MQ=255) aTCAGGTTTATAAGTCTTGATAATATCTATGCAAAACAGCGGGTTATGAGAAAATTGAACCTga  <  1:594014/64‑1 (MQ=255) aTCAGGTTTATAAGTCTTGATAATATCTATGCAAAACAGCGGGTTATGAGAAAATTGAACCTga  <  1:680877/64‑1 (MQ=255) aTCAGGTTTATAAGTCTTGATAATATCTATGCAAAACAGCGGGTTATGAGAAAATTGAACCTga  <  1:712856/64‑1 (MQ=255) aTCAGGTTTATAAGTCTTGATAATATCTATGCAAAACAGCGGGTTATGAGAAAATTGAACCTga  <  1:72097/64‑1 (MQ=255) aTCAGGTTTATAAGTCTTGATAATATCTATGCAAAACAGCGGGTTATGAGAAAATTGAACCTga  <  1:721078/64‑1 (MQ=255) aTCAGGTTTATAAGTCTTGATAATATCTATGCAAAACAGCGGGTTATGAGAAAATTGAACCTga  <  1:851848/64‑1 (MQ=255) aTCAGGTTTATAAGTCTTGATAATATCTATGCAAAACAGCGGGTTATGAGAAAATTGAACCTga  <  1:86757/64‑1 (MQ=255) aTCAGGTTTATAAGTCTTGATAATATCTATGCAAAACAGCGGGTTATGAGAAAATTGAACCTga  <  1:897940/64‑1 (MQ=255) aTCAGGTTTATAAGTCTTGATAATATCTATGCAAAACAGCGGGTTATGAGAAAATTGAACCTga  <  1:904546/64‑1 (MQ=255) aTCAGGTTTATAAGTCTTGATAATATCTATGCAAAACAGCGGGTTATGAGAAAATTGAACCTga  <  1:927011/64‑1 (MQ=255) aTCAGGTTTATAAGTCTTGATAATATCTATGCAAAACAGCGGGTTATGAGAAAATTGAACCTga  <  1:149660/64‑1 (MQ=255) aTCAGGTTTATAAGTCTTGATAATATCTATGCAAAACAGCGGGTTATGAGAAAATTGAACCTga  <  1:1059379/64‑1 (MQ=255) aTCAGGTTTATAAGTCTTGATAATATCTATGCAAAACAGCGGGTTATGAGAAAATTGAACCTga  <  1:1098451/64‑1 (MQ=255) aTCAGGTTTATAAGTCTTGATAATATCTATGCAAAACAGCGGGTTATGAGAAAATTGAACCTga  <  1:1120918/64‑1 (MQ=255) aTCAGGTTTATAAGTCTTGATAATATCTATGCAAAACAGCGGGTTATGAGAAAATTGAACCTga  <  1:1139371/64‑1 (MQ=255) aTCAGGTTTATAAGTCTTGATAATATCTATGCAAAACAGCGGGTTATGAGAAAATTGAACCTga  <  1:1187909/64‑1 (MQ=255) aTCAGGTTTATAAGTCTTGATAATATCTATGCAAAACAGCGGGTTATGAGAAAATTGAACCTga  <  1:1210654/64‑1 (MQ=255) aTCAGGTTTATAAGTCTTGATAATATCTATGCAAAACAGCGGGTTATGAGAAAATTGAACCTga  <  1:1251285/64‑1 (MQ=255) aTCAGGTTTATAAGTCTTGATAATATCTATGCAAAACAGCGGGTTATGAGAAAATTGAACCTga  <  1:132240/64‑1 (MQ=255) aTCAGGTTTATAAGTCTTGATAATATCTATGCAAAACAGCGGGTTATGAGAAAATTGAACCTga  <  1:1345800/64‑1 (MQ=255) aTCAGGTTTATAAGTCTTGATAATATCTATGCAAAACAGCGGGTTATGAGAAAATTGAACCTga  <  1:1346022/64‑1 (MQ=255) aTCAGGTTTATAAGTCTTGATAATATCTATGCAAAACAGCGGGTTATGAGAAAATTGAACCTga  <  1:1456587/64‑1 (MQ=255) aTCAGGTTTATAAGTCTTGATAATATCTATGCAAAACAGCGGGTTATGAGAAAATTGAACCTga  <  1:1468400/64‑1 (MQ=255) aTCAGGTTTATAAGTCTTGATAATATCTATGCAAAACAGCGGGTTATGAGAAAATTGAACCTga  <  1:1785509/64‑1 (MQ=255) aTCAGGTTTATAAGTCTTGATAATATCTATGCAAAACAGCGGGTTATGAGAAAATTGAACCTga  <  1:1557114/64‑1 (MQ=255) aTCAGGTTTATAAGTCTTGATAATATCTATGCAAAACAGCGGGTTATGAGAAAATTGAACCTga  <  1:1562770/64‑1 (MQ=255) aTCAGGTTTATAAGTCTTGATAATATCTATGCAAAACAGCGGGTTATGAGAAAATTGAACCTga  <  1:1608314/64‑1 (MQ=255) aTCAGGTTTATAAGTCTTGATAATATCTATGCAAAACAGCGGGTTATGAGAAAATTGAACCTga  <  1:1637215/64‑1 (MQ=255) aTCAGGTTTATAAGTCTTGATAATATCTATGCAAAACAGCGGGTTATGAGAAAATTGAACCTga  <  1:1682203/64‑1 (MQ=255) aTCAGGTTTATAAGTCTTGATAATATCTATGCAAAACAGCGGGTTATGAGAAAATTGAACCTga  <  1:1709032/64‑1 (MQ=255) aTCAGGTTTATAAGTCTTGATAATATCTATGCAAAACAGCGGGTTATGAGAAAATTGAACCTga  <  1:1778326/64‑1 (MQ=255) aTCAGGTTTATAAGTCTTGATAATATCTATGCAAAACAGCGGGTTATGAGAAAATTGAACCTga  <  1:1780484/64‑1 (MQ=255) aTCAGGTTTATAAGGCTTGATAATATCTATGCAAAACAGCGGGTTATGAGAAAATTGAACCTga  <  1:1677388/64‑1 (MQ=255)  tCAGGTTTATAAGTCTTGATAATATCTATGCAAAACAGCGGGTTATGAGAAAATTGAACCTga  <  1:883465/63‑1 (MQ=255)  tCAGGTTTATAAGTCTTGATAATATCTATGCAAAACAGCGGGTTATGAGAAAATTGAACCTga  <  1:180914/63‑1 (MQ=255)   cAGGTTTATAAGTCTTGATAATATCTATGCAAAACAGCGGGTTATGAGAAAATTGAACCTga  <  1:347326/62‑1 (MQ=255)   cAGGTTTATAAGTCTTGATAATATCTATGCAAAACAGCGGGTTATGAGAAAATTGAACCTga  <  1:1772942/62‑1 (MQ=255)   cAGGTTTATAAGTCTTGATAATATCTATGCAAAACAGCGGGTTATGAGAAAATTGAACCTga  <  1:1872751/62‑1 (MQ=255)             aGTCTTGATAATATCTATGCAAAACAGCGGGTTATGAGAAAATTGAACCTga  <  1:682325/52‑1 (MQ=255)                                                                | ATCAGGTTTATAAGTCTTGATAATATCTATGCAAAACAGCGGGTTATGAGAAAATTGAACCTGA  >  W3110S.gb/2530256‑2530319

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑