Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2547959	2548103	145	186 [0]	[0] 42	cysP	thiosulfate transporter subunit

CCGGGTTATTCACGCGGTAGTAATAGTCGGTGATGATGGTTTGCGCCTGCGGGCTATAGAGCCAG  >  W3110S.gb/2548104‑2548168 |                                                                 ccGGGTTATTCACGCGGTAGTAATAGTCGGTGATGATGGTTTgcg                      >  1:1100242/1‑45 (MQ=255) ccGGGTTATTCACGCGGTAGTAATAGTCGGTGATGATGGTTTGCGCCTGCGGGCTATAGAGCCa   >  1:93506/1‑64 (MQ=255) ccGGGTTATTCACGCGGTAGTAATAGTCGGTGATGATGGTTTGCGCCTGCGGGCTATAGAGCCa   >  1:1761381/1‑64 (MQ=255) ccGGGTTATTCACGCGGTAGTAATAGTCGGTGATGATGGTTTGCGCCTGCGGGCTATAGAGCCa   >  1:728787/1‑64 (MQ=255) ccGGGTTATTCACGCGGTAGTAATAGTCGGTGATGATGGTTTGCGCCTGCGGGCTATAGAGCCa   >  1:375423/1‑64 (MQ=255) ccGGGTTATTCACGCGGTAGTAATAGTCGGTGATGATGGTTTGCGCCTGCGGGCTATAGAGCCAg  >  1:643903/1‑65 (MQ=255) ccGGGTTATTCACGCGGTAGTAATAGTCGGTGATGATGGTTTGCGCCTGCGGGCTATAGAGCCAg  >  1:1863314/1‑65 (MQ=255) ccGGGTTATTCACGCGGTAGTAATAGTCGGTGATGATGGTTTGCGCCTGCGGGCTATAGAGCCAg  >  1:194665/1‑65 (MQ=255) ccGGGTTATTCACGCGGTAGTAATAGTCGGTGATGATGGTTTGCGCCTGCGGGCTATAGAGCCAg  >  1:224391/1‑65 (MQ=255) ccGGGTTATTCACGCGGTAGTAATAGTCGGTGATGATGGTTTGCGCCTGCGGGCTATAGAGCCAg  >  1:311234/1‑65 (MQ=255) ccGGGTTATTCACGCGGTAGTAATAGTCGGTGATGATGGTTTGCGCCTGCGGGCTATAGAGCCAg  >  1:564500/1‑65 (MQ=255) ccGGGTTATTCACGCGGTAGTAATAGTCGGTGATGATGGTTTGCGCCTGCGGGCTATAGAGCCAg  >  1:611547/1‑65 (MQ=255) ccGGGTTATTCACGCGGTAGTAATAGTCGGTGATGATGGTTTGCGCCTGCGGGCTATAGAGCCAg  >  1:627452/1‑65 (MQ=255) ccGGGTTATTCACGCGGTAGTAATAGTCGGTGATGATGGTTTGCGCCTGCGGGCTATAGAGCCAg  >  1:634285/1‑65 (MQ=255) ccGGGTTATTCACGCGGTAGTAATAGTCGGTGATGATGGTTTGCGCCTGCGGGCTATAGAGCCAg  >  1:1785727/1‑65 (MQ=255) ccGGGTTATTCACGCGGTAGTAATAGTCGGTGATGATGGTTTGCGCCTGCGGGCTATAGAGCCAg  >  1:667587/1‑65 (MQ=255) ccGGGTTATTCACGCGGTAGTAATAGTCGGTGATGATGGTTTGCGCCTGCGGGCTATAGAGCCAg  >  1:696029/1‑65 (MQ=255) ccGGGTTATTCACGCGGTAGTAATAGTCGGTGATGATGGTTTGCGCCTGCGGGCTATAGAGCCAg  >  1:70202/1‑65 (MQ=255) ccGGGTTATTCACGCGGTAGTAATAGTCGGTGATGATGGTTTGCGCCTGCGGGCTATAGAGCCAg  >  1:702727/1‑65 (MQ=255) ccGGGTTATTCACGCGGTAGTAATAGTCGGTGATGATGGTTTGCGCCTGCGGGCTATAGAGCCAg  >  1:74987/1‑65 (MQ=255) ccGGGTTATTCACGCGGTAGTAATAGTCGGTGATGATGGTTTGCGCCTGCGGGCTATAGAGCCAg  >  1:916046/1‑65 (MQ=255) ccGGGTTATTCACGCGGTAGTAATAGTCGGTGATGATGGTTTGCGCCTGCGGGCTATAGAGCCAg  >  1:956336/1‑65 (MQ=255) ccGGGTTATTCACGCGGTAGTAATAGTCGGTGATGATGGTTTGCGCCTGCGGGCTATAGAGCCAg  >  1:1386045/1‑65 (MQ=255) ccGGGTTATTCACGCGGTAGTAATAGTCGGTGATGATGGTTTGCGCCTGCGGGCTATAGAGCCAg  >  1:1087755/1‑65 (MQ=255) ccGGGTTATTCACGCGGTAGTAATAGTCGGTGATGATGGTTTGCGCCTGCGGGCTATAGAGCCAg  >  1:1115449/1‑65 (MQ=255) ccGGGTTATTCACGCGGTAGTAATAGTCGGTGATGATGGTTTGCGCCTGCGGGCTATAGAGCCAg  >  1:1146589/1‑65 (MQ=255) ccGGGTTATTCACGCGGTAGTAATAGTCGGTGATGATGGTTTGCGCCTGCGGGCTATAGAGCCAg  >  1:1157931/1‑65 (MQ=255) ccGGGTTATTCACGCGGTAGTAATAGTCGGTGATGATGGTTTGCGCCTGCGGGCTATAGAGCCAg  >  1:1194860/1‑65 (MQ=255) ccGGGTTATTCACGCGGTAGTAATAGTCGGTGATGATGGTTTGCGCCTGCGGGCTATAGAGCCAg  >  1:1227078/1‑65 (MQ=255) ccGGGTTATTCACGCGGTAGTAATAGTCGGTGATGATGGTTTGCGCCTGCGGGCTATAGAGCCAg  >  1:1304280/1‑65 (MQ=255) ccGGGTTATTCACGCGGTAGTAATAGTCGGTGATGATGGTTTGCGCCTGCGGGCTATAGAGCCAg  >  1:1312523/1‑65 (MQ=255) ccGGGTTATTCACGCGGTAGTAATAGTCGGTGATGATGGTTTGCGCCTGCGGGCTATAGAGCCAg  >  1:136359/1‑65 (MQ=255) ccGGGTTATTCACGCGGTAGTAATAGTCGGTGATGATGGTTTGCGCCTGCGGGCTATAGAGCCAg  >  1:1810715/1‑65 (MQ=255) ccGGGTTATTCACGCGGTAGTAATAGTCGGTGATGATGGTTTGCGCCTGCGGGCTATAGAGCCAg  >  1:146059/1‑65 (MQ=255) ccGGGTTATTCACGCGGTAGTAATAGTCGGTGATGATGGTTTGCGCCTGCGGGCTATAGAGCCAg  >  1:1541352/1‑65 (MQ=255) ccGGGTTATTCACGCGGTAGTAATAGTCGGTGATGATGGTTTGCGCCTGCGGGCTATAGAGCCAg  >  1:1553526/1‑65 (MQ=255) ccGGGTTATTCACGCGGTAGTAATAGTCGGTGATGATGGTTTGCGCCTGCGGGCTATAGAGCCAg  >  1:1554113/1‑65 (MQ=255) ccGGGTTATTCACGCGGTAGTAATAGTCGGTGATGATGGTTTGCGCCTGCGGGCTATAGAGCCAg  >  1:1581244/1‑65 (MQ=255) ccGGGTTATTCACGCGGTAGTAATAGTCGGTGATGATGGTTTGCGCCTGCGGGCTATAGAGCCAg  >  1:1723083/1‑65 (MQ=255) ccGGGTTATTCACGCGGTAGTAATAGTCGGTGATGATGGTTTGCGCCTGCGGGCTATAGAGCCAg  >  1:1728471/1‑65 (MQ=255) ccGGGTTATTCACGCGGTAGTAATAGTCGGTGATGATGGTTTGCGCCTGCGGGCTATAGAGCCAg  >  1:1777636/1‑65 (MQ=255) ccGGGTTATTCACGCGGTAGTAATAGTCGGTGATGATGGTTTGCGCCTGCGGGCTATAGAGCCAg  >  1:1011289/1‑65 (MQ=255) |                                                                 CCGGGTTATTCACGCGGTAGTAATAGTCGGTGATGATGGTTTGCGCCTGCGGGCTATAGAGCCAG  >  W3110S.gb/2548104‑2548168

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑