Missing coverage evidence...
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GCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGT  >  W3110S.gb/2561894‑2561956 |                                                               gCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGt  <  1:409552/63‑1 (MQ=255) gCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGt  <  1:183353/63‑1 (MQ=255) gCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGt  <  1:184131/63‑1 (MQ=255) gCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGt  <  1:1872489/63‑1 (MQ=255) gCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGt  <  1:201200/63‑1 (MQ=255) gCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGt  <  1:205899/63‑1 (MQ=255) gCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGt  <  1:209592/63‑1 (MQ=255) gCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGt  <  1:271682/63‑1 (MQ=255) gCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGt  <  1:286316/63‑1 (MQ=255) gCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGt  <  1:287313/63‑1 (MQ=255) gCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGt  <  1:297514/63‑1 (MQ=255) gCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGt  <  1:398273/63‑1 (MQ=255) gCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGt  <  1:1814522/63‑1 (MQ=255) gCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGt  <  1:516963/63‑1 (MQ=255) gCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGt  <  1:539124/63‑1 (MQ=255) gCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGt  <  1:578465/63‑1 (MQ=255) gCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGt  <  1:627974/63‑1 (MQ=255) gCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGt  <  1:630917/63‑1 (MQ=255) gCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGt  <  1:686410/63‑1 (MQ=255) gCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGt  <  1:697191/63‑1 (MQ=255) gCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGt  <  1:765651/63‑1 (MQ=255) gCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGt  <  1:810473/63‑1 (MQ=255) gCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGt  <  1:912392/63‑1 (MQ=255) gCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGt  <  1:9247/63‑1 (MQ=255) gCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGt  <  1:1397246/63‑1 (MQ=255) gCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGt  <  1:1087541/63‑1 (MQ=255) gCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGt  <  1:112273/63‑1 (MQ=255) gCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGt  <  1:1182935/63‑1 (MQ=255) gCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGt  <  1:1197672/63‑1 (MQ=255) gCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGt  <  1:120474/63‑1 (MQ=255) gCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGt  <  1:124521/63‑1 (MQ=255) gCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGt  <  1:1281183/63‑1 (MQ=255) gCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGt  <  1:1304913/63‑1 (MQ=255) gCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGt  <  1:1310364/63‑1 (MQ=255) gCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGt  <  1:1320572/63‑1 (MQ=255) gCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGt  <  1:1386353/63‑1 (MQ=255) gCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGt  <  1:1060467/63‑1 (MQ=255) gCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGt  <  1:1412128/63‑1 (MQ=255) gCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGt  <  1:1436042/63‑1 (MQ=255) gCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGt  <  1:1473757/63‑1 (MQ=255) gCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGt  <  1:1474610/63‑1 (MQ=255) gCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGt  <  1:1535501/63‑1 (MQ=255) gCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGt  <  1:1545093/63‑1 (MQ=255) gCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGt  <  1:1621317/63‑1 (MQ=255) gCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGt  <  1:172678/63‑1 (MQ=255) gCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGt  <  1:1787674/63‑1 (MQ=255) gCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGt  <  1:1806940/63‑1 (MQ=255) gCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGt  <  1:1807103/63‑1 (MQ=255) |                                                               GCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGT  >  W3110S.gb/2561894‑2561956

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑