Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2656900	2656979	80	3 [0]	[0] 36	hscA	DnaK‑like molecular chaperone specific for IscU

GGCGATCACGCCTTCCTGACCGGAATCCAGCCCGTAGGCGATAGCCGCAGCGGTCGGTTCGTTA  >  W3110S.gb/2656980‑2657043 |                                                                ggCGATCACGCCTTCCTGACCGGAATCCAGCCCGTAGGCGAt                        >  1:1195118/1‑42 (MQ=255) ggCGATCACGCCTTCCTGACCGGAATCCAGCCCGTAGGCGATAGCCg                   >  1:1809946/1‑47 (MQ=255) ggCGATCACGCCTTCCTGACCGGAATCCAGCCCGTAGGCGATAGCCTCAGCGGTCGGTTCGTta  >  1:1080034/1‑64 (MQ=255) ggCGATCACGCCTTCCTGACCGGAATCCAGCCCGTAGGCGATAGCCGCAGCGGTCGGTTCg     >  1:1604574/1‑61 (MQ=255) ggCGATCACGCCTTCCTGACCGGAATCCAGCCCGTAGGCGATAGCCGCAGCGGTCGGTTCGTta  >  1:655234/1‑64 (MQ=255) ggCGATCACGCCTTCCTGACCGGAATCCAGCCCGTAGGCGATAGCCGCAGCGGTCGGTTCGTta  >  1:633273/1‑64 (MQ=255) ggCGATCACGCCTTCCTGACCGGAATCCAGCCCGTAGGCGATAGCCGCAGCGGTCGGTTCGTta  >  1:620112/1‑64 (MQ=255) ggCGATCACGCCTTCCTGACCGGAATCCAGCCCGTAGGCGATAGCCGCAGCGGTCGGTTCGTta  >  1:618592/1‑64 (MQ=255) ggCGATCACGCCTTCCTGACCGGAATCCAGCCCGTAGGCGATAGCCGCAGCGGTCGGTTCGTta  >  1:556329/1‑64 (MQ=255) ggCGATCACGCCTTCCTGACCGGAATCCAGCCCGTAGGCGATAGCCGCAGCGGTCGGTTCGTta  >  1:484159/1‑64 (MQ=255) ggCGATCACGCCTTCCTGACCGGAATCCAGCCCGTAGGCGATAGCCGCAGCGGTCGGTTCGTta  >  1:1149714/1‑64 (MQ=255) ggCGATCACGCCTTCCTGACCGGAATCCAGCCCGTAGGCGATAGCCGCAGCGGTCGGTTCGTta  >  1:468231/1‑64 (MQ=255) ggCGATCACGCCTTCCTGACCGGAATCCAGCCCGTAGGCGATAGCCGCAGCGGTCGGTTCGTta  >  1:457783/1‑64 (MQ=255) ggCGATCACGCCTTCCTGACCGGAATCCAGCCCGTAGGCGATAGCCGCAGCGGTCGGTTCGTta  >  1:921555/1‑64 (MQ=255) ggCGATCACGCCTTCCTGACCGGAATCCAGCCCGTAGGCGATAGCCGCAGCGGTCGGTTCGTta  >  1:392715/1‑64 (MQ=255) ggCGATCACGCCTTCCTGACCGGAATCCAGCCCGTAGGCGATAGCCGCAGCGGTCGGTTCGTta  >  1:37782/1‑64 (MQ=255) ggCGATCACGCCTTCCTGACCGGAATCCAGCCCGTAGGCGATAGCCGCAGCGGTCGGTTCGTta  >  1:333250/1‑64 (MQ=255) ggCGATCACGCCTTCCTGACCGGAATCCAGCCCGTAGGCGATAGCCGCAGCGGTCGGTTCGTta  >  1:297469/1‑64 (MQ=255) ggCGATCACGCCTTCCTGACCGGAATCCAGCCCGTAGGCGATAGCCGCAGCGGTCGGTTCGTta  >  1:295240/1‑64 (MQ=255) ggCGATCACGCCTTCCTGACCGGAATCCAGCCCGTAGGCGATAGCCGCAGCGGTCGGTTCGTta  >  1:28766/1‑64 (MQ=255) ggCGATCACGCCTTCCTGACCGGAATCCAGCCCGTAGGCGATAGCCGCAGCGGTCGGTTCGTta  >  1:285517/1‑64 (MQ=255) ggCGATCACGCCTTCCTGACCGGAATCCAGCCCGTAGGCGATAGCCGCAGCGGTCGGTTCGTta  >  1:272882/1‑64 (MQ=255) ggCGATCACGCCTTCCTGACCGGAATCCAGCCCGTAGGCGATAGCCGCAGCGGTCGGTTCGTta  >  1:2339/1‑64 (MQ=255) ggCGATCACGCCTTCCTGACCGGAATCCAGCCCGTAGGCGATAGCCGCAGCGGTCGGTTCGTta  >  1:233551/1‑64 (MQ=255) ggCGATCACGCCTTCCTGACCGGAATCCAGCCCGTAGGCGATAGCCGCAGCGGTCGGTTCGTta  >  1:203973/1‑64 (MQ=255) ggCGATCACGCCTTCCTGACCGGAATCCAGCCCGTAGGCGATAGCCGCAGCGGTCGGTTCGTta  >  1:1856683/1‑64 (MQ=255) ggCGATCACGCCTTCCTGACCGGAATCCAGCCCGTAGGCGATAGCCGCAGCGGTCGGTTCGTta  >  1:1776973/1‑64 (MQ=255) ggCGATCACGCCTTCCTGACCGGAATCCAGCCCGTAGGCGATAGCCGCAGCGGTCGGTTCGTta  >  1:1642379/1‑64 (MQ=255) ggCGATCACGCCTTCCTGACCGGAATCCAGCCCGTAGGCGATAGCCGCAGCGGTCGGTTCGTta  >  1:1519376/1‑64 (MQ=255) ggCGATCACGCCTTCCTGACCGGAATCCAGCCCGTAGGCGATAGCCGCAGCGGTCGGTTCGTta  >  1:1356511/1‑64 (MQ=255) ggCGATCACGCCTTCCTGACCGGAATCCAGCCCGTAGGCGATAGCCGCAGCGGTCGGTTCGTta  >  1:1287923/1‑64 (MQ=255) ggCGATCACGCCTTCCTGACCGGAATCCAGCCCGTAGGCGATAGCCGCAGCGGTCGGTTCGTta  >  1:1248373/1‑64 (MQ=255) ggCGATCACGCCTTCCTGACCGGAATCCAGCCCGTAGGCGATAGCCGCAGCGGTCGGTTCGTta  >  1:1241141/1‑64 (MQ=255) ggCGATCACGCCTTCCTGACCGGAATCCAGCCCGTAGGCGATAGCCGCAGCGGTCGGTTCGTta  >  1:1214885/1‑64 (MQ=255) ggCGATCACGCCTTCCTGACCGGAATCCAGCCCGTAGGCGATAGCCGCAGCGGTCGGTTCGTta  >  1:1156647/1‑64 (MQ=255) ggCGATCACGCCTTCCTGACCCGAATCCAGCCCGTAGGCGATAGCCGCAGCGGTCGGTTCGTta  >  1:971170/1‑64 (MQ=255) |                                                                GGCGATCACGCCTTCCTGACCGGAATCCAGCCCGTAGGCGATAGCCGCAGCGGTCGGTTCGTTA  >  W3110S.gb/2656980‑2657043

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑