Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 2708143 2708167 25 2 [0] [0] 144 rpoE RNA polymerase, sigma 24 (sigma E) factor

Only 100 of 144 total aligned reads displayed.

TACCGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTA  >  W3110S.gb/2708168‑2708232
|                                                                
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:45872/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:673523/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:648516/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:623960/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:6233/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:612464/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:577036/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:564171/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:505224/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:499563/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:488203/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:480005/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:463265/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:704951/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:451555/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:425591/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:376152/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:368128/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:362226/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:343804/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:343317/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:31819/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:302946/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:274039/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:27243/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:806071/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:985120/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:967430/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:963767/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:957374/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:94236/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:935933/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:879847/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:876649/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:874721/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:856824/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:823767/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:809957/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:257502/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:78939/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:782928/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:777784/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:777017/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:770481/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:759834/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:758928/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:742616/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:735064/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:708643/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:707522/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:120886/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:149658/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:1466276/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:1393733/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:1352941/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:1316738/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:131318/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:1283858/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:1275609/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:1272751/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:1253472/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:1248418/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:1232739/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:1515339/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:1163696/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:1152990/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:1147802/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:1146882/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:1137743/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:1121995/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:1114743/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:1107080/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:1078012/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:10464/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:1037298/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:1761576/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:229341/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:203426/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:1883271/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:1874063/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:1844138/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:1832113/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:1816450/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:1805975/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:1805522/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:1790090/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:1780877/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:1771379/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:1036270/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:1733887/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:1712050/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:1703944/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:1692258/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:1668415/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:1640560/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:1636831/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:1595586/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:1582268/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:1547379/65‑1 (MQ=255)
taccGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTa  <  1:1544594/65‑1 (MQ=255)
|                                                                
TACCGGACAATCCATGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTA  >  W3110S.gb/2708168‑2708232

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑