Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2745664	2745884	221	19 [0]	[0] 47	ffh	Signal Recognition Particle (SRP) component with 4.5S RNA (ffs)

CACCAGCAGCACGTCGTAGAATTTCAGTTTGGCTTCTTTCAGCGCCGCGTTAA  >  W3110S.gb/2745885‑2745937 |                                                     caccaGGAGCACGTCGTAGAATTTCAGTTTGGCTTCTTTCAGCGCCGCGTTaa  <  1:1396570/53‑1 (MQ=255) caccaGCAGCACGTCGTAGAATTTCAGTTTGGCTTCTTTCAGCGCCGCGttta  <  1:762895/53‑3 (MQ=255) caccaGCAGCACGTCGTAGAATTTCAGTTTGGCTTCTTTCAGCGCCGCGTTaa  <  1:680052/53‑1 (MQ=255) caccaGCAGCACGTCGTAGAATTTCAGTTTGGCTTCTTTCAGCGCCGCGTTaa  <  1:1831329/53‑1 (MQ=255) caccaGCAGCACGTCGTAGAATTTCAGTTTGGCTTCTTTCAGCGCCGCGTTaa  <  1:1861638/53‑1 (MQ=255) caccaGCAGCACGTCGTAGAATTTCAGTTTGGCTTCTTTCAGCGCCGCGTTaa  <  1:240081/53‑1 (MQ=255) caccaGCAGCACGTCGTAGAATTTCAGTTTGGCTTCTTTCAGCGCCGCGTTaa  <  1:251580/53‑1 (MQ=255) caccaGCAGCACGTCGTAGAATTTCAGTTTGGCTTCTTTCAGCGCCGCGTTaa  <  1:279687/53‑1 (MQ=255) caccaGCAGCACGTCGTAGAATTTCAGTTTGGCTTCTTTCAGCGCCGCGTTaa  <  1:313606/53‑1 (MQ=255) caccaGCAGCACGTCGTAGAATTTCAGTTTGGCTTCTTTCAGCGCCGCGTTaa  <  1:337900/53‑1 (MQ=255) caccaGCAGCACGTCGTAGAATTTCAGTTTGGCTTCTTTCAGCGCCGCGTTaa  <  1:376973/53‑1 (MQ=255) caccaGCAGCACGTCGTAGAATTTCAGTTTGGCTTCTTTCAGCGCCGCGTTaa  <  1:401471/53‑1 (MQ=255) caccaGCAGCACGTCGTAGAATTTCAGTTTGGCTTCTTTCAGCGCCGCGTTaa  <  1:49084/53‑1 (MQ=255) caccaGCAGCACGTCGTAGAATTTCAGTTTGGCTTCTTTCAGCGCCGCGTTaa  <  1:510798/53‑1 (MQ=255) caccaGCAGCACGTCGTAGAATTTCAGTTTGGCTTCTTTCAGCGCCGCGTTaa  <  1:1828706/53‑1 (MQ=255) caccaGCAGCACGTCGTAGAATTTCAGTTTGGCTTCTTTCAGCGCCGCGTTaa  <  1:692508/53‑1 (MQ=255) caccaGCAGCACGTCGTAGAATTTCAGTTTGGCTTCTTTCAGCGCCGCGTTaa  <  1:731730/53‑1 (MQ=255) caccaGCAGCACGTCGTAGAATTTCAGTTTGGCTTCTTTCAGCGCCGCGTTaa  <  1:743111/53‑1 (MQ=255) caccaGCAGCACGTCGTAGAATTTCAGTTTGGCTTCTTTCAGCGCCGCGTTaa  <  1:787772/53‑1 (MQ=255) caccaGCAGCACGTCGTAGAATTTCAGTTTGGCTTCTTTCAGCGCCGCGTTaa  <  1:789443/53‑1 (MQ=255) caccaGCAGCACGTCGTAGAATTTCAGTTTGGCTTCTTTCAGCGCCGCGTTaa  <  1:873328/53‑1 (MQ=255) caccaGCAGCACGTCGTAGAATTTCAGTTTGGCTTCTTTCAGCGCCGCGTTaa  <  1:909719/53‑1 (MQ=255) caccaGCAGCACGTCGTAGAATTTCAGTTTGGCTTCTTTCAGCGCCGCGTTaa  <  1:939823/53‑1 (MQ=255) caccaGCAGCACGTCGTAGAATTTCAGTTTGGCTTCTTTCAGCGCCGCGTTaa  <  1:960721/53‑1 (MQ=255) caccaGCAGCACGTCGTAGAATTTCAGTTTGGCTTCTTTCAGCGCCGCGTTaa  <  1:1423750/53‑1 (MQ=255) caccaGCAGCACGTCGTAGAATTTCAGTTTGGCTTCTTTCAGCGCCGCGTTaa  <  1:1165717/53‑1 (MQ=255) caccaGCAGCACGTCGTAGAATTTCAGTTTGGCTTCTTTCAGCGCCGCGTTaa  <  1:1167773/53‑1 (MQ=255) caccaGCAGCACGTCGTAGAATTTCAGTTTGGCTTCTTTCAGCGCCGCGTTaa  <  1:1175958/53‑1 (MQ=255) caccaGCAGCACGTCGTAGAATTTCAGTTTGGCTTCTTTCAGCGCCGCGTTaa  <  1:1176308/53‑1 (MQ=255) caccaGCAGCACGTCGTAGAATTTCAGTTTGGCTTCTTTCAGCGCCGCGTTaa  <  1:1206977/53‑1 (MQ=255) caccaGCAGCACGTCGTAGAATTTCAGTTTGGCTTCTTTCAGCGCCGCGTTaa  <  1:1247521/53‑1 (MQ=255) caccaGCAGCACGTCGTAGAATTTCAGTTTGGCTTCTTTCAGCGCCGCGTTaa  <  1:1276150/53‑1 (MQ=255) caccaGCAGCACGTCGTAGAATTTCAGTTTGGCTTCTTTCAGCGCCGCGTTaa  <  1:1278370/53‑1 (MQ=255) caccaGCAGCACGTCGTAGAATTTCAGTTTGGCTTCTTTCAGCGCCGCGTTaa  <  1:1287969/53‑1 (MQ=255) caccaGCAGCACGTCGTAGAATTTCAGTTTGGCTTCTTTCAGCGCCGCGTTaa  <  1:1401625/53‑1 (MQ=255) caccaGCAGCACGTCGTAGAATTTCAGTTTGGCTTCTTTCAGCGCCGCGTTaa  <  1:1413941/53‑1 (MQ=255) caccaGCAGCACGTCGTAGAATTTCAGTTTGGCTTCTTTCAGCGCCGCGTTaa  <  1:1829836/53‑1 (MQ=255) caccaGCAGCACGTCGTAGAATTTCAGTTTGGCTTCTTTCAGCGCCGCGTTaa  <  1:1482305/53‑1 (MQ=255) caccaGCAGCACGTCGTAGAATTTCAGTTTGGCTTCTTTCAGCGCCGCGTTaa  <  1:1495442/53‑1 (MQ=255) caccaGCAGCACGTCGTAGAATTTCAGTTTGGCTTCTTTCAGCGCCGCGTTaa  <  1:1554825/53‑1 (MQ=255) caccaGCAGCACGTCGTAGAATTTCAGTTTGGCTTCTTTCAGCGCCGCGTTaa  <  1:1634401/53‑1 (MQ=255) caccaGCAGCACGTCGTAGAATTTCAGTTTGGCTTCTTTCAGCGCCGCGTTaa  <  1:1654450/53‑1 (MQ=255) caccaGCAGCACGTCGTAGAATTTCAGTTTGGCTTCTTTCAGCGCCGCGTTaa  <  1:1718813/53‑1 (MQ=255) caccaGCAGCACGTCGTAGAATTTCAGTTTGGCTTCTTTCAGCGCCGCGTTaa  <  1:1746616/53‑1 (MQ=255) caccaGCAGCACGTCGTAGAATTTCAGTTTGGCTTCTTTCAGCGCCGCGTTaa  <  1:1782122/53‑1 (MQ=255) caccaGCAGCACGTCGTAGAATTTCAGTTTGGCTTCTTTCAGCGCCGCGTTaa  <  1:179888/53‑1 (MQ=255) caccaGCAGCACGTCGTAGAATTTCAGTTTGGCTTCTTTCAGCGCCGCGTTaa  <  1:109307/53‑1 (MQ=255) |                                                     CACCAGCAGCACGTCGTAGAATTTCAGTTTGGCTTCTTTCAGCGCCGCGTTAA  >  W3110S.gb/2745885‑2745937

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑