Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2746573	2746669	97	47 [0]	[0] 41	ypjD	predicted inner membrane protein

TGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTC  >  W3110S.gb/2746670‑2746734 |                                                                 tGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTg       >  1:538665/1‑60 (MQ=255) tGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCgg    >  1:1008483/1‑63 (MQ=255) tGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCg     >  1:1085622/1‑62 (MQ=255) tGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGt   >  1:500303/1‑64 (MQ=255) tGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGt   >  1:522551/1‑64 (MQ=255) tGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGt   >  1:1810496/1‑64 (MQ=255) tGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGt   >  1:544685/1‑64 (MQ=255) tGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGt   >  1:1661453/1‑64 (MQ=255) tGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTc  >  1:618720/1‑65 (MQ=255) tGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTc  >  1:364898/1‑65 (MQ=255) tGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTc  >  1:3694/1‑65 (MQ=255) tGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTc  >  1:419153/1‑65 (MQ=255) tGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTc  >  1:551622/1‑65 (MQ=255) tGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTc  >  1:280086/1‑65 (MQ=255) tGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTc  >  1:641503/1‑65 (MQ=255) tGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTc  >  1:660855/1‑65 (MQ=255) tGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTc  >  1:736945/1‑65 (MQ=255) tGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTc  >  1:747815/1‑65 (MQ=255) tGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTc  >  1:865058/1‑65 (MQ=255) tGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTc  >  1:877604/1‑65 (MQ=255) tGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTc  >  1:943264/1‑65 (MQ=255) tGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTc  >  1:956671/1‑65 (MQ=255) tGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTc  >  1:980321/1‑65 (MQ=255) tGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTc  >  1:1389240/1‑65 (MQ=255) tGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTc  >  1:1043879/1‑65 (MQ=255) tGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTc  >  1:1077551/1‑65 (MQ=255) tGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTc  >  1:1110072/1‑65 (MQ=255) tGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTc  >  1:1116397/1‑65 (MQ=255) tGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTc  >  1:1118818/1‑65 (MQ=255) tGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTc  >  1:1144305/1‑65 (MQ=255) tGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTc  >  1:1180455/1‑65 (MQ=255) tGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTc  >  1:1362405/1‑65 (MQ=255) tGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTc  >  1:354005/1‑65 (MQ=255) tGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTc  >  1:1430740/1‑65 (MQ=255) tGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTc  >  1:1455395/1‑65 (MQ=255) tGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTc  >  1:1716437/1‑65 (MQ=255) tGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTc  >  1:1730920/1‑65 (MQ=255) tGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTc  >  1:1813399/1‑65 (MQ=255) tGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTc  >  1:219724/1‑65 (MQ=255) tGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTc  >  1:258300/1‑65 (MQ=255) tGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTc  >  1:314776/1‑65 (MQ=255) |                                                                 TGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTC  >  W3110S.gb/2746670‑2746734

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑