Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2746850	2746981	132	96 [0]	[0] 30	ypjD	predicted inner membrane protein

CTGGGATGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTG  >  W3110S.gb/2746982‑2747046 |                                                                 cTGGGATGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTGTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTg  <  1:526791/65‑1 (MQ=255) cTGGGATGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTg  <  1:195168/65‑1 (MQ=255) cTGGGATGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTg  <  1:960618/65‑1 (MQ=255) cTGGGATGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTg  <  1:707233/65‑1 (MQ=255) cTGGGATGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTg  <  1:65858/65‑1 (MQ=255) cTGGGATGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTg  <  1:626406/65‑1 (MQ=255) cTGGGATGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTg  <  1:556945/65‑1 (MQ=255) cTGGGATGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTg  <  1:536138/65‑1 (MQ=255) cTGGGATGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTg  <  1:450217/65‑1 (MQ=255) cTGGGATGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTg  <  1:403892/65‑1 (MQ=255) cTGGGATGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTg  <  1:39384/65‑1 (MQ=255) cTGGGATGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTg  <  1:357228/65‑1 (MQ=255) cTGGGATGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTg  <  1:352975/65‑1 (MQ=255) cTGGGATGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTg  <  1:294370/65‑1 (MQ=255) cTGGGATGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTg  <  1:285564/65‑1 (MQ=255) cTGGGATGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTg  <  1:1010722/65‑1 (MQ=255) cTGGGATGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTg  <  1:1843083/65‑1 (MQ=255) cTGGGATGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTg  <  1:1667664/65‑1 (MQ=255) cTGGGATGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTg  <  1:1643042/65‑1 (MQ=255) cTGGGATGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTg  <  1:1637529/65‑1 (MQ=255) cTGGGATGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTg  <  1:1635400/65‑1 (MQ=255) cTGGGATGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTg  <  1:1624320/65‑1 (MQ=255) cTGGGATGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTg  <  1:1571551/65‑1 (MQ=255) cTGGGATGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTg  <  1:156123/65‑1 (MQ=255) cTGGGATGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTg  <  1:1294506/65‑1 (MQ=255) cTGGGATGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTg  <  1:107445/65‑1 (MQ=255) cTGGGATGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTg  <  1:1037117/65‑1 (MQ=255) cTGGGATGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCATg  <  1:1618/65‑1 (MQ=255) cTGGGATGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACCCTAATTATCGCCGCCCTg  <  1:1727248/65‑1 (MQ=255) cTGGGATGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCAACGCTAATTATCGCCGCCCTg  <  1:1016260/65‑1 (MQ=255) |                                                                 CTGGGATGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTG  >  W3110S.gb/2746982‑2747046

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑