Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 2786234 2786242 9 155 [1] [0] 119 ygaR/yqaC hypothetical protein/ECK2651:JW5426:b2657; conserved hypothetical protein

Only 100 of 119 total aligned reads displayed.

AGAAAAGCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCAA  >  W3110S.gb/2786243‑2786306
|                                                               
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAACACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:1775691/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:428299/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:669238/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:615845/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:609177/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:582189/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:57267/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:566364/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:559758/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:559508/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:55607/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:545421/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:542588/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:467302/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:677035/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:394534/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:392857/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:379870/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:344515/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:327408/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:304000/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:281690/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:236238/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:211250/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:211021/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:817635/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:972828/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:964449/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:957553/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:948286/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:947992/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:920398/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:920157/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:910305/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:909743/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:883520/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:859223/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:849673/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:194545/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:801777/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:798341/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:780022/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:77646/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:773928/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:769170/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:711923/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:699408/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:683165/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:68081/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:679880/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:1144632/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:1022117/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:1423228/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:1372625/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:1352754/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:1311080/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:1296659/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:1286504/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:1282595/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:126981/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:1235556/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:1182857/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:1153249/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:1424619/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:1142615/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:1133879/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:1106486/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:1071774/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:1067683/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:1066395/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:1056725/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:1048051/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:1043325/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:1042133/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:1029611/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:1679208/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:1862683/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:182267/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:1806179/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:1804610/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:1803387/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:1794863/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:1793281/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:1765277/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:1755182/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:1716024/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:1704936/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:1439949/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:1635114/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:1625171/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:161358/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:1548009/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:1529923/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:1490782/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:148728/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:1482116/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:1478806/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:1473308/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACAAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:1255943/64‑1 (MQ=255)
agaaaagCGTTTAAATGGAATGCCAAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCaa  <  1:289106/64‑1 (MQ=255)
|                                                               
AGAAAAGCGTTTAAATGGAATGCCTAAAACAACACCCAAAAGTGACCAGGTTATTATGTTGCAA  >  W3110S.gb/2786243‑2786306

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: