Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	235823	236058	236	11 [0]	[1] 69	[rnhA]	[rnhA]

ATGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGAA  >  W3110S.gb/236058‑236122  |                                                                aTGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCgg        >  1:1823914/1‑59 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCTCTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:977723/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACTGAAACCACCGGTATGaa  <  1:876676/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCTAAACCACCGGTATGaa  <  1:1718938/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATTaa  <  1:2836/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:506099/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:618806/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:612905/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:593888/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:583690/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:571899/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:568117/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:561382/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:644327/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:493919/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:455586/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:354196/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:338789/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:310413/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:777163/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:101027/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:951908/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:948227/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:922296/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:875462/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:810409/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:808191/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:798021/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:642530/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:767064/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:761603/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:733273/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:703762/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:683393/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:67350/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:997946/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:1232604/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:1342289/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:13351/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:1317830/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:1299394/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:1295884/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:129282/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:1270373/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:1266633/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:1378630/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:1225961/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:1219104/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:1190277/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:1174968/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:1090365/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:1045318/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:104262/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:305930/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:1412829/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:145017/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:1454759/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:1458805/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:1611249/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:1771848/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:1774965/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:1797978/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:1847604/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:1848311/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:1881119/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:194001/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:229088/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:247226/64‑1 (MQ=255)  tGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCACGATACCGAAACCACCGGTATGaa  <  1:451922/64‑1 (MQ=255)  |                                                                ATGACCGCTATGAGCACTGCAATTACACGCCAGATCGTTCTCGATACCGAAACCACCGGTATGAA  >  W3110S.gb/236058‑236122

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑