Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2880061	2880156	96	136 [0]	[0] 89	ygcJ	hypothetical protein

CAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCA  >  W3110S.gb/2880157‑2880220 |                                                                cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTTAATGATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATct  <  1:1358100/64‑2 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTTAATATCAGAATCa  <  1:703400/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:277699/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:496625/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:478172/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:474713/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:465293/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:430901/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:407238/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:378109/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:336028/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:32911/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:285955/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:518247/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:268460/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:267465/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:266200/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:252534/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:236272/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:234162/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:208496/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:197322/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:192934/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:1876756/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:655672/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:98642/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:955835/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:851691/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:769237/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:75276/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:729103/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:726226/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:721368/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:702160/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:668599/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:507372/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:651404/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:649796/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:632968/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:629464/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:599042/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:596896/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:550487/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:545108/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:1839783/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:1157629/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:1407749/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:138639/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:1305284/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:125852/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:1251652/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:1226087/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:1204811/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:1199984/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:11981/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:1157817/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:1459558/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:1112559/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:110988/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:1108842/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:1086487/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:1060898/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:1059514/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:1043174/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:1032979/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:1029393/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:1008738/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:1616132/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:1827358/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:181410/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:1804520/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:1803799/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:1763904/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:1762302/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:1717865/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:1683936/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:1679863/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:1640417/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:1001199/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:1605034/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:1532635/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:1521283/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:1507942/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:150349/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:1502747/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:1499287/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:148530/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:1459769/64‑1 (MQ=255) cAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCCACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCa  <  1:432229/64‑1 (MQ=255) |                                                                CAGATGTGCAGAACCTTGTTCCTGTAAATCATCTACAGCGGTGAACCAGTCAATATCAGAATCA  >  W3110S.gb/2880157‑2880220

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑