Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2883341	2883563	223	31 [0]	[0] 29	ygcB	conserved hypothetical protein, member of DEAD box family

GCCCACTGCAGGACCTTGCGAGCCTTGAACCTTTTTTCACACTCGGCGCTTTCAAATTTATCCA  >  W3110S.gb/2883564‑2883627 |                                                                gCCCACTGCAGGACCTTGCGAGCCTTGAACCTTTTTTCACACTCGGCGCTTTCAAATTTATCCa  <  1:1848735/64‑1 (MQ=255) gCCCACTGCAGGACCTTGCGAGCCTTGAACCTTTTTTCACACTCGGCGCTTTCAAATTTATCCa  <  1:959855/64‑1 (MQ=255) gCCCACTGCAGGACCTTGCGAGCCTTGAACCTTTTTTCACACTCGGCGCTTTCAAATTTATCCa  <  1:891293/64‑1 (MQ=255) gCCCACTGCAGGACCTTGCGAGCCTTGAACCTTTTTTCACACTCGGCGCTTTCAAATTTATCCa  <  1:84498/64‑1 (MQ=255) gCCCACTGCAGGACCTTGCGAGCCTTGAACCTTTTTTCACACTCGGCGCTTTCAAATTTATCCa  <  1:829815/64‑1 (MQ=255) gCCCACTGCAGGACCTTGCGAGCCTTGAACCTTTTTTCACACTCGGCGCTTTCAAATTTATCCa  <  1:690004/64‑1 (MQ=255) gCCCACTGCAGGACCTTGCGAGCCTTGAACCTTTTTTCACACTCGGCGCTTTCAAATTTATCCa  <  1:630320/64‑1 (MQ=255) gCCCACTGCAGGACCTTGCGAGCCTTGAACCTTTTTTCACACTCGGCGCTTTCAAATTTATCCa  <  1:551606/64‑1 (MQ=255) gCCCACTGCAGGACCTTGCGAGCCTTGAACCTTTTTTCACACTCGGCGCTTTCAAATTTATCCa  <  1:502112/64‑1 (MQ=255) gCCCACTGCAGGACCTTGCGAGCCTTGAACCTTTTTTCACACTCGGCGCTTTCAAATTTATCCa  <  1:360465/64‑1 (MQ=255) gCCCACTGCAGGACCTTGCGAGCCTTGAACCTTTTTTCACACTCGGCGCTTTCAAATTTATCCa  <  1:344308/64‑1 (MQ=255) gCCCACTGCAGGACCTTGCGAGCCTTGAACCTTTTTTCACACTCGGCGCTTTCAAATTTATCCa  <  1:272510/64‑1 (MQ=255) gCCCACTGCAGGACCTTGCGAGCCTTGAACCTTTTTTCACACTCGGCGCTTTCAAATTTATCCa  <  1:240588/64‑1 (MQ=255) gCCCACTGCAGGACCTTGCGAGCCTTGAACCTTTTTTCACACTCGGCGCTTTCAAATTTATCCa  <  1:236632/64‑1 (MQ=255) gCCCACTGCAGGACCTTGCGAGCCTTGAACCTTTTTTCACACTCGGCGCTTTCAAATTTATCCa  <  1:202262/64‑1 (MQ=255) gCCCACTGCAGGACCTTGCGAGCCTTGAACCTTTTTTCACACTCGGCGCTTTCAAATTTATCCa  <  1:1007544/64‑1 (MQ=255) gCCCACTGCAGGACCTTGCGAGCCTTGAACCTTTTTTCACACTCGGCGCTTTCAAATTTATCCa  <  1:1785334/64‑1 (MQ=255) gCCCACTGCAGGACCTTGCGAGCCTTGAACCTTTTTTCACACTCGGCGCTTTCAAATTTATCCa  <  1:1689700/64‑1 (MQ=255) gCCCACTGCAGGACCTTGCGAGCCTTGAACCTTTTTTCACACTCGGCGCTTTCAAATTTATCCa  <  1:1663268/64‑1 (MQ=255) gCCCACTGCAGGACCTTGCGAGCCTTGAACCTTTTTTCACACTCGGCGCTTTCAAATTTATCCa  <  1:1571965/64‑1 (MQ=255) gCCCACTGCAGGACCTTGCGAGCCTTGAACCTTTTTTCACACTCGGCGCTTTCAAATTTATCCa  <  1:1529500/64‑1 (MQ=255) gCCCACTGCAGGACCTTGCGAGCCTTGAACCTTTTTTCACACTCGGCGCTTTCAAATTTATCCa  <  1:1421639/64‑1 (MQ=255) gCCCACTGCAGGACCTTGCGAGCCTTGAACCTTTTTTCACACTCGGCGCTTTCAAATTTATCCa  <  1:1193843/64‑1 (MQ=255) gCCCACTGCAGGACCTTGCGAGCCTTGAACCTTTTTTCACACTCGGCGCTTTCAAATTTATCCa  <  1:1132264/64‑1 (MQ=255) gCCCACTGCAGGACCTTGCGAGCCTTGAACCTTTTTTCACACTCGGCGCTTTCAAATTTATCCa  <  1:1089909/64‑1 (MQ=255) gCCCACTGCAGGACCTTGCGAGCCTTGAACCTTTTTTCACACTCGGCGCTTTCAAATTTATCCa  <  1:1077788/64‑1 (MQ=255) gCCCACTGCAGGACCTTGCGAGCCTTGAACCTTTTTTCACACTCGGCGCTTTCAAATTTATCCa  <  1:107033/64‑1 (MQ=255) gCCCACTGCAGGACCTTGCGAGCCTTGAACCTTTTTTCACACTCGGCGCTTTCAAATTTATCCa  <  1:106428/64‑1 (MQ=255) gCCCACTGCAGGACCTTGCGAGCCTTGAACCTTTTTTCACACTCGGCGCTTTCAAATTTATCCa  <  1:1046322/64‑1 (MQ=255) |                                                                GCCCACTGCAGGACCTTGCGAGCCTTGAACCTTTTTTCACACTCGGCGCTTTCAAATTTATCCA  >  W3110S.gb/2883564‑2883627

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑