Missing coverage evidence...
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AGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAGG  >  W3110S.gb/2896853‑2896915 |                                                               aGTCATCGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAgg  <  1:578292/63‑1 (MQ=255) aGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTGCATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAgg  <  1:1718212/63‑1 (MQ=255) aGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGagagc  <  1:314436/63‑2 (MQ=255) aGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAgg  <  1:656630/63‑1 (MQ=255) aGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAgg  <  1:410735/63‑1 (MQ=255) aGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAgg  <  1:424676/63‑1 (MQ=255) aGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAgg  <  1:426792/63‑1 (MQ=255) aGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAgg  <  1:444199/63‑1 (MQ=255) aGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAgg  <  1:512745/63‑1 (MQ=255) aGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAgg  <  1:61144/63‑1 (MQ=255) aGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAgg  <  1:633508/63‑1 (MQ=255) aGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAgg  <  1:36003/63‑1 (MQ=255) aGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAgg  <  1:661642/63‑1 (MQ=255) aGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAgg  <  1:720965/63‑1 (MQ=255) aGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAgg  <  1:750183/63‑1 (MQ=255) aGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAgg  <  1:860972/63‑1 (MQ=255) aGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAgg  <  1:864113/63‑1 (MQ=255) aGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAgg  <  1:877493/63‑1 (MQ=255) aGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAgg  <  1:881592/63‑1 (MQ=255) aGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAgg  <  1:933445/63‑1 (MQ=255) aGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAgg  <  1:996819/63‑1 (MQ=255) aGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAgg  <  1:1591785/63‑1 (MQ=255) aGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAgg  <  1:1181547/63‑1 (MQ=255) aGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAgg  <  1:1192153/63‑1 (MQ=255) aGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAgg  <  1:1250767/63‑1 (MQ=255) aGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAgg  <  1:1336446/63‑1 (MQ=255) aGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAgg  <  1:1537650/63‑1 (MQ=255) aGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAgg  <  1:1556133/63‑1 (MQ=255) aGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAgg  <  1:1568755/63‑1 (MQ=255) aGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAgg  <  1:1586714/63‑1 (MQ=255) aGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAgg  <  1:407452/63‑1 (MQ=255) aGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAgg  <  1:159720/63‑1 (MQ=255) aGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAgg  <  1:1729631/63‑1 (MQ=255) aGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAgg  <  1:1845389/63‑1 (MQ=255) aGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAgg  <  1:277968/63‑1 (MQ=255) aGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAgg  <  1:302624/63‑1 (MQ=255) aGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAgg  <  1:321921/63‑1 (MQ=255) aGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAgg  <  1:333704/63‑1 (MQ=255) aGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAgg  <  1:1003477/63‑1 (MQ=255) |                                                               AGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAGG  >  W3110S.gb/2896853‑2896915

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑