Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2900558	2900576	19	18 [0]	[0] 56	ygcE	predicted kinase

TTGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTACGATCTGGAAGGTAACGTGGTTTGCGAA  >  W3110S.gb/2900577‑2900641 |                                                                 ttGATTGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTCATGTACGATCTGGAAGGTAACGTGGTTTGCGaa  >  1:175747/1‑65 (MQ=255) ttGATGGCGGAAGTCATAGCACAAAAGAGGTGATGTACGATCTg                       >  1:773585/1‑44 (MQ=38) ttGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTa                              >  1:181127/1‑37 (MQ=255) ttGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTAc                             >  1:125062/1‑38 (MQ=255) ttGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTACg                            >  1:982730/1‑39 (MQ=255) ttGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTACGATCTGGAAGGTAACGTGGTTTGCGaa  >  1:287104/1‑65 (MQ=255) ttGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTACGATCTGGAAGGTAACGTGGTTTGCGaa  >  1:267871/1‑65 (MQ=255) ttGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTACGATCTGGAAGGTAACGTGGTTTGCGaa  >  1:354678/1‑65 (MQ=255) ttGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTACGATCTGGAAGGTAACGTGGTTTGCGaa  >  1:427396/1‑65 (MQ=255) ttGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTACGATCTGGAAGGTAACGTGGTTTGCGaa  >  1:438619/1‑65 (MQ=255) ttGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTACGATCTGGAAGGTAACGTGGTTTGCGaa  >  1:454322/1‑65 (MQ=255) ttGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTACGATCTGGAAGGTAACGTGGTTTGCGaa  >  1:522766/1‑65 (MQ=255) ttGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTACGATCTGGAAGGTAACGTGGTTTGCGaa  >  1:547349/1‑65 (MQ=255) ttGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTACGATCTGGAAGGTAACGTGGTTTGCGaa  >  1:548344/1‑65 (MQ=255) ttGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTACGATCTGGAAGGTAACGTGGTTTGCGaa  >  1:558678/1‑65 (MQ=255) ttGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTACGATCTGGAAGGTAACGTGGTTTGCGaa  >  1:623151/1‑65 (MQ=255) ttGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTACGATCTGGAAGGTAACGTGGTTTGCGaa  >  1:626190/1‑65 (MQ=255) ttGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTACGATCTGGAAGGTAACGTGGTTTGCGaa  >  1:741615/1‑65 (MQ=255) ttGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTACGATCTGGAAGGTAACGTGGTTTGCGaa  >  1:810462/1‑65 (MQ=255) ttGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTACGATCTGGAAGGTAACGTGGTTTGCGaa  >  1:813899/1‑65 (MQ=255) ttGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTACGATCTGGAAGGTAACGTGGTTTGCGaa  >  1:842180/1‑65 (MQ=255) ttGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTACGATCTGGAAGGTAACGTGGTTTGCGaa  >  1:858653/1‑65 (MQ=255) ttGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTACGATCTGGAAGGTAACGTGGTTTGCGaa  >  1:871563/1‑65 (MQ=255) ttGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTACGATCTGGAAGGTAACGTGGTTTGCGaa  >  1:927515/1‑65 (MQ=255) ttGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTACGATCTGGAAGGTAACGTGGTTTGCGaa  >  1:932479/1‑65 (MQ=255) ttGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTACGATCTGGAAGGTAACGTGGTTTGCGaa  >  1:943048/1‑65 (MQ=255) ttGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTACGATCTGGAAGGTAACGTGGTTTGCGaa  >  1:958419/1‑65 (MQ=255) ttGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTACGATCTGGAAGGTAACGTGGTTTGCGaa  >  1:971227/1‑65 (MQ=255) ttGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTACGATCTGGAAGGTAACGTGGTTTGCGaa  >  1:162335/1‑65 (MQ=255) ttGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTACGATCTGGAAGGTAACGTGGTTTGCGaa  >  1:1034013/1‑65 (MQ=255) ttGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTACGATCTGGAAGGTAACGTGGTTTGCGaa  >  1:1079150/1‑65 (MQ=255) ttGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTACGATCTGGAAGGTAACGTGGTTTGCGaa  >  1:1200455/1‑65 (MQ=255) ttGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTACGATCTGGAAGGTAACGTGGTTTGCGaa  >  1:1217549/1‑65 (MQ=255) ttGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTACGATCTGGAAGGTAACGTGGTTTGCGaa  >  1:1268051/1‑65 (MQ=255) ttGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTACGATCTGGAAGGTAACGTGGTTTGCGaa  >  1:1316921/1‑65 (MQ=255) ttGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTACGATCTGGAAGGTAACGTGGTTTGCGaa  >  1:13407/1‑65 (MQ=255) ttGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTACGATCTGGAAGGTAACGTGGTTTGCGaa  >  1:1393700/1‑65 (MQ=255) ttGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTACGATCTGGAAGGTAACGTGGTTTGCGaa  >  1:1429131/1‑65 (MQ=255) ttGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTACGATCTGGAAGGTAACGTGGTTTGCGaa  >  1:1461550/1‑65 (MQ=255) ttGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTACGATCTGGAAGGTAACGTGGTTTGCGaa  >  1:1483999/1‑65 (MQ=255) ttGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTACGATCTGGAAGGTAACGTGGTTTGCGaa  >  1:160721/1‑65 (MQ=255) ttGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTACGATCTGGAAGGTAACGTGGTTTGCGaa  >  1:1028873/1‑65 (MQ=255) ttGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTACGATCTGGAAGGTAACGTGGTTTGCGaa  >  1:162384/1‑65 (MQ=255) ttGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTACGATCTGGAAGGTAACGTGGTTTGCGaa  >  1:1661722/1‑65 (MQ=255) ttGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTACGATCTGGAAGGTAACGTGGTTTGCGaa  >  1:1689339/1‑65 (MQ=255) ttGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTACGATCTGGAAGGTAACGTGGTTTGCGaa  >  1:1690462/1‑65 (MQ=255) ttGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTACGATCTGGAAGGTAACGTGGTTTGCGaa  >  1:1725778/1‑65 (MQ=255) ttGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTACGATCTGGAAGGTAACGTGGTTTGCGaa  >  1:1801471/1‑65 (MQ=255) ttGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTACGATCTGGAAGGTAACGTGGTTTGCGaa  >  1:1804445/1‑65 (MQ=255) ttGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTACGATCTGGAAGGTAACGTGGTTTGCGaa  >  1:1816780/1‑65 (MQ=255) ttGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTACGATCTGGAAGGTAACGTGGTTTGCGaa  >  1:181844/1‑65 (MQ=255) ttGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTACGATCTGGAAGGTAACGTGGTTTGCGaa  >  1:251576/1‑65 (MQ=255) ttGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTACGATCTGGAAGGTAACGTGGTTTGCGaa  >  1:254260/1‑65 (MQ=255) ttGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTACGATCTGGAAGGTAACGTGGTTTGCGa   >  1:712777/1‑64 (MQ=255) ttGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTACGATCTGGAAGGTAACGTGGTTTGCGa   >  1:742226/1‑64 (MQ=255) ttGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTACGATCTGGAAGGTAACGTGGTTTGCGa   >  1:446264/1‑64 (MQ=255) |                                                                 TTGATGGCGGAAGTCAGAGCACAAAAGTGGTGATGTACGATCTGGAAGGTAACGTGGTTTGCGAA  >  W3110S.gb/2900577‑2900641

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑