Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2989520	2989545	26	92 [0]	[0] 37	ygeF	hypothetical protein

TTCACTACTATATGCACAGACGTTCTATCCCCCCGCGTCACCAGACATAATAAAGAAAAAAACAA  >  W3110S.gb/2989546‑2989610 |                                                                 ttCACTACTATATGCACAGACGTTCTATCCCCCCGCGTCACCAGACATAATAAAGAAAAaaccaa  <  1:1068118/65‑1 (MQ=255) ttCACTACTATATGCACAGACGTTCTATCCCCCCGCGTCACCAGACATAATAAAGAAAAaaacaa  <  1:41861/65‑1 (MQ=255) ttCACTACTATATGCACAGACGTTCTATCCCCCCGCGTCACCAGACATAATAAAGAAAAaaacaa  <  1:169410/65‑1 (MQ=255) ttCACTACTATATGCACAGACGTTCTATCCCCCCGCGTCACCAGACATAATAAAGAAAAaaacaa  <  1:1731362/65‑1 (MQ=255) ttCACTACTATATGCACAGACGTTCTATCCCCCCGCGTCACCAGACATAATAAAGAAAAaaacaa  <  1:1747368/65‑1 (MQ=255) ttCACTACTATATGCACAGACGTTCTATCCCCCCGCGTCACCAGACATAATAAAGAAAAaaacaa  <  1:1853397/65‑1 (MQ=255) ttCACTACTATATGCACAGACGTTCTATCCCCCCGCGTCACCAGACATAATAAAGAAAAaaacaa  <  1:1875480/65‑1 (MQ=255) ttCACTACTATATGCACAGACGTTCTATCCCCCCGCGTCACCAGACATAATAAAGAAAAaaacaa  <  1:1884582/65‑1 (MQ=255) ttCACTACTATATGCACAGACGTTCTATCCCCCCGCGTCACCAGACATAATAAAGAAAAaaacaa  <  1:338889/65‑1 (MQ=255) ttCACTACTATATGCACAGACGTTCTATCCCCCCGCGTCACCAGACATAATAAAGAAAAaaacaa  <  1:379232/65‑1 (MQ=255) ttCACTACTATATGCACAGACGTTCTATCCCCCCGCGTCACCAGACATAATAAAGAAAAaaacaa  <  1:1646724/65‑1 (MQ=255) ttCACTACTATATGCACAGACGTTCTATCCCCCCGCGTCACCAGACATAATAAAGAAAAaaacaa  <  1:440083/65‑1 (MQ=255) ttCACTACTATATGCACAGACGTTCTATCCCCCCGCGTCACCAGACATAATAAAGAAAAaaacaa  <  1:56587/65‑1 (MQ=255) ttCACTACTATATGCACAGACGTTCTATCCCCCCGCGTCACCAGACATAATAAAGAAAAaaacaa  <  1:645058/65‑1 (MQ=255) ttCACTACTATATGCACAGACGTTCTATCCCCCCGCGTCACCAGACATAATAAAGAAAAaaacaa  <  1:674733/65‑1 (MQ=255) ttCACTACTATATGCACAGACGTTCTATCCCCCCGCGTCACCAGACATAATAAAGAAAAaaacaa  <  1:728592/65‑1 (MQ=255) ttCACTACTATATGCACAGACGTTCTATCCCCCCGCGTCACCAGACATAATAAAGAAAAaaacaa  <  1:772269/65‑1 (MQ=255) ttCACTACTATATGCACAGACGTTCTATCCCCCCGCGTCACCAGACATAATAAAGAAAAaaacaa  <  1:897538/65‑1 (MQ=255) ttCACTACTATATGCACAGACGTTCTATCCCCCCGCGTCACCAGACATAATAAAGAAAAaaacaa  <  1:953592/65‑1 (MQ=255) ttCACTACTATATGCACAGACGTTCTATCCCCCCGCGTCACCAGACATAATAAAGAAAAaaacaa  <  1:1391644/65‑1 (MQ=255) ttCACTACTATATGCACAGACGTTCTATCCCCCCGCGTCACCAGACATAATAAAGAAAAaaacaa  <  1:1091198/65‑1 (MQ=255) ttCACTACTATATGCACAGACGTTCTATCCCCCCGCGTCACCAGACATAATAAAGAAAAaaacaa  <  1:1103968/65‑1 (MQ=255) ttCACTACTATATGCACAGACGTTCTATCCCCCCGCGTCACCAGACATAATAAAGAAAAaaacaa  <  1:1154481/65‑1 (MQ=255) ttCACTACTATATGCACAGACGTTCTATCCCCCCGCGTCACCAGACATAATAAAGAAAAaaacaa  <  1:1156796/65‑1 (MQ=255) ttCACTACTATATGCACAGACGTTCTATCCCCCCGCGTCACCAGACATAATAAAGAAAAaaacaa  <  1:1202066/65‑1 (MQ=255) ttCACTACTATATGCACAGACGTTCTATCCCCCCGCGTCACCAGACATAATAAAGAAAAaaacaa  <  1:1224924/65‑1 (MQ=255) ttCACTACTATATGCACAGACGTTCTATCCCCCCGCGTCACCAGACATAATAAAGAAAAaaacaa  <  1:1235731/65‑1 (MQ=255) ttCACTACTATATGCACAGACGTTCTATCCCCCCGCGTCACCAGACATAATAAAGAAAAaaacaa  <  1:1627515/65‑1 (MQ=255) ttCACTACTATATGCACAGACGTTCTATCCCCCCGCGTCACCAGACATAATAAAGAAAAaaacaa  <  1:1441272/65‑1 (MQ=255) ttCACTACTATATGCACAGACGTTCTATCCCCCCGCGTCACCAGACATAATAAAGAAAAaaacaa  <  1:1473524/65‑1 (MQ=255) ttCACTACTATATGCACAGACGTTCTATCCCCCCGCGTCACCAGACATAATAAAGAAAAaaacaa  <  1:1474298/65‑1 (MQ=255) ttCACTACTATATGCACAGACGTTCTATCCCCCCGCGTCACCAGACATAATAAAGAAAAaaacaa  <  1:1489819/65‑1 (MQ=255) ttCACTACTATATGCACAGACGTTCTATCCCCCCGCGTCACCAGACATAATAAAGAAAAaaacaa  <  1:1523420/65‑1 (MQ=255) ttCACTACTATATGCACAGACGTTCTATCCCCCCGCGTCACCAGACATAATAAAGAAAAaaacaa  <  1:1606692/65‑1 (MQ=255) ttCACTACTATATGCACAGACGTTCTATCCCCCCGCGTCACCAGACATAATAAAGAAAAaaacaa  <  1:1625295/65‑1 (MQ=255) ttCACTACTATATCCACAGACGTTCTATCCCCCCGCGTCACCAGACATAATAAAGAAAAaaacaa  <  1:340095/65‑1 (MQ=255) ttCAATACTATATGCACAGACGTTCTATCCCCCCGCGTCACCAGACATAATAAAGAAAAaaacaa  <  1:114730/65‑1 (MQ=255) |                                                                 TTCACTACTATATGCACAGACGTTCTATCCCCCCGCGTCACCAGACATAATAAAGAAAAAAACAA  >  W3110S.gb/2989546‑2989610

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑