Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3043312	3043402	91	7 [0]	[0] 40	bglA	6‑phospho‑beta‑glucosidase A

TTGCGAACTGTATGAGCGTTATCAGAGGCCGCTGTTTATTGTCGAAAACGGTTTTGGCGCTTAC  >  W3110S.gb/3043403‑3043466 |                                                                ttGCGTACTGTATGAGCGTTATCAGAGGCCGCTGTTTATTGTc                       >  1:1057965/1‑43 (MQ=255) ttGCGAACTGTATGAGCGTTATCAGAGGCCGCTGTTTATTGTCGa                     >  1:1315535/1‑45 (MQ=255) ttGCGAACTGTATGAGCGTTATCAGAGGCCGCTGTTTATTGTCGAAAACGGtttt           >  1:348135/1‑55 (MQ=255) ttGCGAACTGTATGAGCGTTATCAGAGGCCGCTGTTTATTGTCGAAAACGGt              >  1:1823142/1‑52 (MQ=255) ttGCGAACTGTATGAGCGTTATCAGAGGCCGCTGTTTATTGTCGAAAACGGTTTTGGCGCTTa   >  1:711873/1‑63 (MQ=255) ttGCGAACTGTATGAGCGTTATCAGAGGCCGCTGTTTATTGTCGAAAACGGTTTTGGCGCTTAc  >  1:266888/1‑64 (MQ=255) ttGCGAACTGTATGAGCGTTATCAGAGGCCGCTGTTTATTGTCGAAAACGGTTTTGGCGCTTAc  >  1:953916/1‑64 (MQ=255) ttGCGAACTGTATGAGCGTTATCAGAGGCCGCTGTTTATTGTCGAAAACGGTTTTGGCGCTTAc  >  1:299444/1‑64 (MQ=255) ttGCGAACTGTATGAGCGTTATCAGAGGCCGCTGTTTATTGTCGAAAACGGTTTTGGCGCTTAc  >  1:367759/1‑64 (MQ=255) ttGCGAACTGTATGAGCGTTATCAGAGGCCGCTGTTTATTGTCGAAAACGGTTTTGGCGCTTAc  >  1:386571/1‑64 (MQ=255) ttGCGAACTGTATGAGCGTTATCAGAGGCCGCTGTTTATTGTCGAAAACGGTTTTGGCGCTTAc  >  1:407139/1‑64 (MQ=255) ttGCGAACTGTATGAGCGTTATCAGAGGCCGCTGTTTATTGTCGAAAACGGTTTTGGCGCTTAc  >  1:43767/1‑64 (MQ=255) ttGCGAACTGTATGAGCGTTATCAGAGGCCGCTGTTTATTGTCGAAAACGGTTTTGGCGCTTAc  >  1:479218/1‑64 (MQ=255) ttGCGAACTGTATGAGCGTTATCAGAGGCCGCTGTTTATTGTCGAAAACGGTTTTGGCGCTTAc  >  1:499989/1‑64 (MQ=255) ttGCGAACTGTATGAGCGTTATCAGAGGCCGCTGTTTATTGTCGAAAACGGTTTTGGCGCTTAc  >  1:518179/1‑64 (MQ=255) ttGCGAACTGTATGAGCGTTATCAGAGGCCGCTGTTTATTGTCGAAAACGGTTTTGGCGCTTAc  >  1:673057/1‑64 (MQ=255) ttGCGAACTGTATGAGCGTTATCAGAGGCCGCTGTTTATTGTCGAAAACGGTTTTGGCGCTTAc  >  1:733509/1‑64 (MQ=255) ttGCGAACTGTATGAGCGTTATCAGAGGCCGCTGTTTATTGTCGAAAACGGTTTTGGCGCTTAc  >  1:754116/1‑64 (MQ=255) ttGCGAACTGTATGAGCGTTATCAGAGGCCGCTGTTTATTGTCGAAAACGGTTTTGGCGCTTAc  >  1:812816/1‑64 (MQ=255) ttGCGAACTGTATGAGCGTTATCAGAGGCCGCTGTTTATTGTCGAAAACGGTTTTGGCGCTTAc  >  1:823990/1‑64 (MQ=255) ttGCGAACTGTATGAGCGTTATCAGAGGCCGCTGTTTATTGTCGAAAACGGTTTTGGCGCTTAc  >  1:935534/1‑64 (MQ=255) ttGCGAACTGTATGAGCGTTATCAGAGGCCGCTGTTTATTGTCGAAAACGGTTTTGGCGCTTAc  >  1:1039243/1‑64 (MQ=255) ttGCGAACTGTATGAGCGTTATCAGAGGCCGCTGTTTATTGTCGAAAACGGTTTTGGCGCTTAc  >  1:1593232/1‑64 (MQ=255) ttGCGAACTGTATGAGCGTTATCAGAGGCCGCTGTTTATTGTCGAAAACGGTTTTGGCGCTTAc  >  1:1058857/1‑64 (MQ=255) ttGCGAACTGTATGAGCGTTATCAGAGGCCGCTGTTTATTGTCGAAAACGGTTTTGGCGCTTAc  >  1:1145793/1‑64 (MQ=255) ttGCGAACTGTATGAGCGTTATCAGAGGCCGCTGTTTATTGTCGAAAACGGTTTTGGCGCTTAc  >  1:1152504/1‑64 (MQ=255) ttGCGAACTGTATGAGCGTTATCAGAGGCCGCTGTTTATTGTCGAAAACGGTTTTGGCGCTTAc  >  1:1268457/1‑64 (MQ=255) ttGCGAACTGTATGAGCGTTATCAGAGGCCGCTGTTTATTGTCGAAAACGGTTTTGGCGCTTAc  >  1:1296627/1‑64 (MQ=255) ttGCGAACTGTATGAGCGTTATCAGAGGCCGCTGTTTATTGTCGAAAACGGTTTTGGCGCTTAc  >  1:1322484/1‑64 (MQ=255) ttGCGAACTGTATGAGCGTTATCAGAGGCCGCTGTTTATTGTCGAAAACGGTTTTGGCGCTTAc  >  1:135967/1‑64 (MQ=255) ttGCGAACTGTATGAGCGTTATCAGAGGCCGCTGTTTATTGTCGAAAACGGTTTTGGCGCTTAc  >  1:136190/1‑64 (MQ=255) ttGCGAACTGTATGAGCGTTATCAGAGGCCGCTGTTTATTGTCGAAAACGGTTTTGGCGCTTAc  >  1:1843586/1‑64 (MQ=255) ttGCGAACTGTATGAGCGTTATCAGAGGCCGCTGTTTATTGTCGAAAACGGTTTTGGCGCTTAc  >  1:1662119/1‑64 (MQ=255) ttGCGAACTGTATGAGCGTTATCAGAGGCCGCTGTTTATTGTCGAAAACGGTTTTGGCGCTTAc  >  1:1717973/1‑64 (MQ=255) ttGCGAACTGTATGAGCGTTATCAGAGGCCGCTGTTTATTGTCGAAAACGGTTTTGGCGCTTAc  >  1:1753322/1‑64 (MQ=255) ttGCGAACTGTATGAGCGTTATCAGAGGCCGCTGTTTATTGTCGAAAACGGTTTTGGCGCTTAc  >  1:1788316/1‑64 (MQ=255) ttGCGAACTGTATGAGCGTTATCAGAGGCCGCTGTTTATTGTCGAAAACGGTTTTGGCGCTTAc  >  1:178991/1‑64 (MQ=255) ttGCGAACTGTATGAGCGTTATCAGAGGCCGCTGTTTATTGTCGAAAACGGTTTTGGCGCTTAc  >  1:1799651/1‑64 (MQ=255) ttGCGAACTGTATGAGCGTTATCAGAGGCCGCTGTTTATTGTCGAAAACGGTTTTGGCGCTTAc  >  1:1818205/1‑64 (MQ=255) ttGCGAACTGTATGAGCGTTATCAGAGGCCGCTGTTTATTGTCGAAAACGGTTTTGGCGCTTAc  >  1:183507/1‑64 (MQ=255) |                                                                TTGCGAACTGTATGAGCGTTATCAGAGGCCGCTGTTTATTGTCGAAAACGGTTTTGGCGCTTAC  >  W3110S.gb/3043403‑3043466

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑