Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3070439	3070441	3	10 [0]	[0] 82	pgk	phosphoglycerate kinase

AGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTACGC  >  W3110S.gb/3070442‑3070506 |                                                                 aGCTTTCACATCTTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:1093656/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGTACTCGGTTGCTAcgc  <  1:6532/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:549335/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:606971/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:528723/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:522760/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:5156/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:505758/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:494088/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:483324/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:46937/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:439653/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:426169/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:424347/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:401258/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:391758/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:3755/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:338122/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:335363/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:325018/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:314019/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:836459/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:996645/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:986033/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:981455/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:935576/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:928535/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:904736/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:896660/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:870165/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:860003/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:552083/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:803806/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:787199/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:768937/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:761077/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:709700/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:650937/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:612110/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:608207/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:305674/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:1343734/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:1552173/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:1530169/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:1477814/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:1472189/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:1470057/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:1439677/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:1411360/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:1382476/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:1375721/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:1553550/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:133874/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:1315037/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:1277920/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:1263471/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:122201/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:1200156/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:1196095/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:1147018/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:1094938/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:1668650/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:260871/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:250869/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:248125/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:234661/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:1869204/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:1849910/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:1815100/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:1771435/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:176853/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:1712925/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:1658874/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:1640893/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:1618979/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:1602403/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:160065/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:1577533/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:1576271/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:1554252/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGACGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:277962/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCACAACGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTAcgc  <  1:688395/65‑1 (MQ=255) |                                                                 AGCTTTCACATCGTTAACAGATTTCAGGGTAGCCGGTGCAGTTTCAGAGAACTCGGTTGCTACGC  >  W3110S.gb/3070442‑3070506

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑